57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1287 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  100 
 
 		 200 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  59.26 
 
 		 196 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1661  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  51.83 
 
 		 191 aa  210  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  52.11 
 
 		 194 aa  210  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.474566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0383  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  50.79 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1529  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  50.26 
 
 		 191 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1452  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  51.31 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1046  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.33 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.68 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0197  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.9 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.013421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.72 
 
 		 559 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1309  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.55 
 
 		 247 aa  88.2  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.142506  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.3 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 544 aa  75.1  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 543 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.5 
 
 		 547 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  28.9 
 
 		 551 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.89 
 
 		 540 aa  69.7  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.65 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.82 
 
 		 557 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0146  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.18 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0329177  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.36 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2004  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  26.4 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.390285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0931  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  24.39 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1508  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.35 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1664  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  25.54 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0250  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.99 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00242591  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0156  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E  25.63 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0277  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.22 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0299  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.22 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00199626  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  25.37 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  25.57 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.81 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3700  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.18 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0503  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  24.35 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1094  hypothetical protein  26.4 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2088  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  26.67 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000187806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0788  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  25 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3664  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  23.04 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.985424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.21 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0210  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  24.31 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.264518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1329  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.78 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080332  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  29.9 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1690  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1159  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  25.91 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0346  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  23.21 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  26.19 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1173  fwdE family protein  27.11 
 
 		 175 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000142876  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0860  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  21.28 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1104  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  21.21 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  24 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  22.55 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272508  hitchhiker  0.00939532 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  31.58 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.53 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2992  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.96 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  31.58 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0219  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  25.84 
 
 		 238 aa  41.2  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.459295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>