62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1589 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  68.11 
 
 		 190 aa  274  6e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2004  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  54.3 
 
 		 196 aa  221  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.390285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1664  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  41.99 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0503  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  41.75 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3700  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  41.84 
 
 		 222 aa  157  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1508  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.17 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  37.31 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3664  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.14 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.985424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.24 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272508  hitchhiker  0.00939532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2175  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.58 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  hitchhiker  0.00000414509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1104  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  38.97 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0156  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E  35.68 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0931  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  36.08 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  34.87 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0277  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.25 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0299  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.25 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00199626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0250  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.5 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00242591  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  31.94 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.24 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.15 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2051  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.51 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.887777 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0788  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.53 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1173  fwdE family protein  33.52 
 
 		 175 aa  91.3  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000142876  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  34.27 
 
 		 228 aa  91.3  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.12 
 
 		 206 aa  91.3  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1669  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.59 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0346  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.07 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.65 
 
 		 311 aa  89  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0219  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  31.37 
 
 		 238 aa  89  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.459295 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0210  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.9 
 
 		 192 aa  88.6  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.264518 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0813  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.2 
 
 		 175 aa  88.2  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  31.35 
 
 		 180 aa  88.2  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1690  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.17 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  30.1 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0146  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.16 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0329177  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0994  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.37 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.588329  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0860  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.77 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1159  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  29.1 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1094  hypothetical protein  29.26 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2088  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.65 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000187806  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1329  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.83 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080332  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1046  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.57 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.94 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.69 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0774  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like  33.33 
 
 		 141 aa  62  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.09 
 
 		 557 aa  59.3  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 544 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  29.53 
 
 		 551 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.23 
 
 		 547 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 543 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.17 
 
 		 559 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0360  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.5 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0124463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.04 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1096  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  49.3  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2992  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.91 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0197  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.38 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.013421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like  26.61 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.563765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.72 
 
 		 543 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  38.24 
 
 		 272 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  32.53 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>