69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1625 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  53.96 
 
 		 203 aa  215  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2051  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  44.83 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.887777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  41.03 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0931  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  37.88 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  41.88 
 
 		 205 aa  138  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  39.01 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0250  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  39.18 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00242591  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1669  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.97 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0860  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.08 
 
 		 192 aa  132  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0346  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.29 
 
 		 174 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0146  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.48 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0329177  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  40.1 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1173  fwdE family protein  39.09 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000142876  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0210  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.2 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.264518 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0788  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.11 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686177  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0813  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.47 
 
 		 175 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0299  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.54 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00199626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0277  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.54 
 
 		 179 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.57 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.57 
 
 		 311 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1094  hypothetical protein  38.59 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  38.3 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1690  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.63 
 
 		 192 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0994  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.75 
 
 		 178 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.588329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2088  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  37.97 
 
 		 176 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000187806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1104  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  34.87 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1159  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  37.84 
 
 		 194 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.33 
 
 		 228 aa  99  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.94 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1329  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.96 
 
 		 270 aa  95.5  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080332  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0503  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  33.5 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1664  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  31.91 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2004  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.16 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.390285 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0219  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.06 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.459295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3700  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.85 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.02 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2175  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.11 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  hitchhiker  0.00000414509 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1508  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.28 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.04 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.3 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272508  hitchhiker  0.00939532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  39.78 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0156  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E  31.79 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  35.4 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.8 
 
 		 547 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  32.52 
 
 		 543 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3664  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.02 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.985424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.87 
 
 		 559 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0360  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.3 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0124463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.81 
 
 		 557 aa  58.2  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  31.36 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.95 
 
 		 540 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0774  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like  43.66 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like  29.37 
 
 		 149 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.563765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2992  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.62 
 
 		 152 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.07 
 
 		 543 aa  48.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0383  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.33 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  29.9 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  22.51 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1529  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.63 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  36.76 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0197  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.71 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.013421 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1661  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.19 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1309  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  36.99 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.142506  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1046  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.98 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.63 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.474566  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1096  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  41.6  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1452  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  33.33 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1551  phage integrase family protein  22.45 
 
 		 153 aa  41.2  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.567371  decreased coverage  0.00000568825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>