61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2359 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  68.11 
 
 		 187 aa  274  6e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2004  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  52.43 
 
 		 196 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.390285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3700  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  43.65 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1664  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  41.14 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0503  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  38.86 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1508  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.62 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0156  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E  38.92 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  37.57 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2175  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.16 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  hitchhiker  0.00000414509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3664  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.85 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.985424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.15 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272508  hitchhiker  0.00939532 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1104  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  36.92 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.84 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.84 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0931  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  31.66 
 
 		 213 aa  100  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1173  fwdE family protein  32.56 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000142876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1669  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.5 
 
 		 223 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0346  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.82 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0299  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.03 
 
 		 176 aa  92  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00199626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0277  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.03 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2051  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  34.36 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.887777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0250  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  31.44 
 
 		 210 aa  89  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00242591  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0813  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.41 
 
 		 175 aa  87.8  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  31.34 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.23 
 
 		 311 aa  87  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0219  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.7 
 
 		 238 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.459295 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.47 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  29.02 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1329  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.41 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080332  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0210  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.95 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.264518 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0788  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.35 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1094  hypothetical protein  27.75 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1690  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.13 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.12 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.85 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  28.79 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0994  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.07 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.588329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2088  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.27 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000187806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0146  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.7 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0329177  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1159  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  27.66 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0860  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.26 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109987  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1046  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.43 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.12 
 
 		 540 aa  62  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.06 
 
 		 557 aa  61.6  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.85 
 
 		 559 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  26.5 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  25.74 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.67 
 
 		 547 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  29.29 
 
 		 551 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0774  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like  31.06 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  25.77 
 
 		 544 aa  55.1  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.32 
 
 		 543 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2992  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.03 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.93 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  28.28 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0197  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  24.73 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.013421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1309  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  24.74 
 
 		 247 aa  45.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.142506  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0360  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.11 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0124463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  31.58 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>