204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0032 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  56.62 
 
 
551 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 
544 aa  1102    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  59.64 
 
 
547 aa  664    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  57.09 
 
 
540 aa  632  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  57.46 
 
 
557 aa  631  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  56.7 
 
 
543 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  55.91 
 
 
559 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  55.39 
 
 
543 aa  587  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  44.87 
 
 
347 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  39.88 
 
 
340 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  43.48 
 
 
344 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  40.64 
 
 
340 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.35 
 
 
337 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  39.35 
 
 
337 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  41.47 
 
 
340 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  38.89 
 
 
340 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  37.46 
 
 
345 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  40.71 
 
 
341 aa  259  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  40.41 
 
 
343 aa  256  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  39.34 
 
 
335 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  38.53 
 
 
341 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  40.18 
 
 
341 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.43 
 
 
341 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  39.59 
 
 
339 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  39.47 
 
 
346 aa  243  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  38.05 
 
 
340 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  36.34 
 
 
344 aa  209  8e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  37.5 
 
 
330 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  34.47 
 
 
324 aa  207  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.71 
 
 
324 aa  206  7e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  36.01 
 
 
339 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  39.13 
 
 
409 aa  183  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  42.13 
 
 
189 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  31.25 
 
 
332 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  30.54 
 
 
329 aa  127  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  31.53 
 
 
330 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  29.03 
 
 
544 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.24 
 
 
539 aa  106  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  30.56 
 
 
342 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1046  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  34.27 
 
 
213 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  26 
 
 
401 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  26 
 
 
321 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0197  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35 
 
 
182 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.013421 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  25.75 
 
 
319 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  28.57 
 
 
336 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.38 
 
 
212 aa  96.7  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  28.9 
 
 
336 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1309  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  39.64 
 
 
247 aa  93.6  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.142506  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  28.49 
 
 
534 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  28.01 
 
 
336 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.97 
 
 
533 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  27.03 
 
 
534 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.45 
 
 
533 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  24.4 
 
 
538 aa  84.3  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  27.13 
 
 
546 aa  84  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  23.05 
 
 
533 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  25.74 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.07 
 
 
534 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  29.94 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  24.06 
 
 
539 aa  80.9  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  22.29 
 
 
342 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.49 
 
 
194 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.474566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  28.89 
 
 
196 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  24.6 
 
 
534 aa  78.2  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.6 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  28.07 
 
 
200 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  26.59 
 
 
575 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  26.51 
 
 
337 aa  69.7  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1661  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.7 
 
 
191 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  23.4 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  35.4 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2151  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  27.18 
 
 
401 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  22.77 
 
 
334 aa  63.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  23.71 
 
 
357 aa  63.5  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0383  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.7 
 
 
191 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1529  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.27 
 
 
191 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  31.96 
 
 
213 aa  61.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.08 
 
 
203 aa  61.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.31 
 
 
205 aa  60.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1452  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  26.59 
 
 
190 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  21.97 
 
 
334 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2569  molybdopterin biosynthesis protein  30.43 
 
 
405 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.635561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.32 
 
 
187 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.84 
 
 
228 aa  58.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.62 
 
 
206 aa  57.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1094  hypothetical protein  32.11 
 
 
205 aa  57.8  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  22.85 
 
 
336 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1669  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.75 
 
 
223 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24910  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  29.8 
 
 
405 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2051  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.98 
 
 
204 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.887777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2130  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  29.8 
 
 
405 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  25.77 
 
 
190 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2004  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.85 
 
 
196 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.390285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1664  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  30.73 
 
 
405 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869903  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.83 
 
 
311 aa  53.9  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0250  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  31.96 
 
 
210 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00242591  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0671  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/unknown domain fusion protein  27.63 
 
 
549 aa  53.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00402297 
 
 
-
 
NC_002936  DET1173  fwdE family protein  32.22 
 
 
175 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000142876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0589  molybdenum cofactor synthesis domain protein  29.68 
 
 
401 aa  52.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.797948  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2123  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  30.34 
 
 
408 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>