171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0685 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  62.14 
 
 
540 aa  701    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  100 
 
 
551 aa  1124    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  58.72 
 
 
559 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  58.15 
 
 
543 aa  638    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  56.62 
 
 
544 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  55.86 
 
 
547 aa  624  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  53.25 
 
 
557 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  54.97 
 
 
543 aa  578  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  42.61 
 
 
347 aa  267  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  38.55 
 
 
345 aa  259  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  40.35 
 
 
346 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  40.06 
 
 
341 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  40.6 
 
 
335 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  38.73 
 
 
340 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  40.69 
 
 
344 aa  246  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  38.15 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  37.39 
 
 
341 aa  243  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.31 
 
 
341 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  40.35 
 
 
341 aa  242  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  38.79 
 
 
340 aa  240  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  37.39 
 
 
340 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.39 
 
 
337 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  37.39 
 
 
337 aa  236  9e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  38.73 
 
 
339 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  35.73 
 
 
340 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  38.44 
 
 
343 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  37.43 
 
 
344 aa  206  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  35.17 
 
 
324 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  38.02 
 
 
330 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  31.93 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  36.84 
 
 
339 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  31.23 
 
 
324 aa  179  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  40.24 
 
 
189 aa  151  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  30.43 
 
 
332 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0197  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.71 
 
 
182 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.013421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  32.9 
 
 
544 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  35.71 
 
 
212 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.35 
 
 
534 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  32.94 
 
 
534 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1046  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.8 
 
 
213 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  29.55 
 
 
329 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.47 
 
 
533 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1309  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  39.51 
 
 
247 aa  99.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.142506  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  31.86 
 
 
342 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.53 
 
 
534 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.69 
 
 
533 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.11 
 
 
534 aa  94  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.51 
 
 
533 aa  94  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  31.94 
 
 
341 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  31.09 
 
 
348 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  29.15 
 
 
546 aa  87  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  28.53 
 
 
336 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  26.38 
 
 
538 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.07 
 
 
539 aa  86.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  29.04 
 
 
330 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  28.82 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.96 
 
 
194 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.474566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  31.03 
 
 
196 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  28.24 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.4 
 
 
538 aa  80.1  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  25.3 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  24.24 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  25.08 
 
 
539 aa  74.7  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  27.24 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  24.24 
 
 
321 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  28.9 
 
 
200 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  28.17 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  28.12 
 
 
575 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1661  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.34 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  27.78 
 
 
334 aa  67  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  27.44 
 
 
333 aa  67  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  27.92 
 
 
336 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1529  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.26 
 
 
191 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0383  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.14 
 
 
191 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  26.38 
 
 
357 aa  65.1  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1452  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  25.68 
 
 
190 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  25.18 
 
 
319 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.29 
 
 
190 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1286  molybdopterin molybdochelatase  29.79 
 
 
403 aa  57  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.724523  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.53 
 
 
187 aa  57  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  31.36 
 
 
202 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4037  molybdopterin adenylyltransferase  37.66 
 
 
197 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.676409  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2569  molybdopterin biosynthesis protein  38.96 
 
 
405 aa  56.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.635561  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  38.14 
 
 
426 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3203  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  30.12 
 
 
414 aa  55.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802141  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  36.36 
 
 
447 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  36.36 
 
 
430 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  32.53 
 
 
401 aa  55.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1641  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  38.64 
 
 
401 aa  54.3  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2556  molybdenum cofactor synthesis domain protein  29.73 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0671  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/unknown domain fusion protein  28.95 
 
 
549 aa  52.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00402297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0691  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  36.36 
 
 
187 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0883262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5873  molybdenum cofactor synthesis domain protein  40.26 
 
 
161 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110863  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  35.44 
 
 
421 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3269  molybdopterin binding domain-containing protein  39.19 
 
 
274 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1329  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.22 
 
 
270 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080332  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  35.44 
 
 
421 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1664  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.18 
 
 
206 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  35.44 
 
 
421 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03854  molybdopterin biosynthesis protein  28.11 
 
 
411 aa  50.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>