69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1936 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  100 
 
 		 334 aa  636    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  98.2 
 
 		 334 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  81.54 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  59.75 
 
 		 337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  56.51 
 
 		 357 aa  298  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  53.39 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  49.85 
 
 		 538 aa  268  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  47.31 
 
 		 544 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  47.35 
 
 		 539 aa  245  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  46.27 
 
 		 538 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  47.02 
 
 		 546 aa  225  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  44.87 
 
 		 539 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  47.75 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.31 
 
 		 533 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.01 
 
 		 533 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.88 
 
 		 533 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  46.43 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  42.26 
 
 		 534 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  46.87 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  46.27 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  41.92 
 
 		 534 aa  199  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  39.81 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  39.81 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  45.37 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  42.9 
 
 		 575 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  40.06 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  41.62 
 
 		 534 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.53 
 
 		 534 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  44.61 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  38.44 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  37.03 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  33.94 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  28.22 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  28.7 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  29.79 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  29.39 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  30 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  28.01 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.38 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  28.32 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  27.38 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  28.91 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  27.98 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  25.91 
 
 		 343 aa  95.9  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  25.08 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  25.31 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  25.73 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.82 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  27.52 
 
 		 339 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  25.52 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  28.35 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  23.1 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  24.77 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.83 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  23.24 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.73 
 
 		 559 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  23.68 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  24.03 
 
 		 557 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.61 
 
 		 540 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  28.17 
 
 		 551 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.29 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  21.97 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  34.55 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3248  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.82 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2808  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.82 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1564  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  32.39 
 
 		 616 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.292001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>