71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1187 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  100 
 
 		 336 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  97.62 
 
 		 336 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  93.15 
 
 		 336 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  70.36 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  67.27 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  64.86 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  59.7 
 
 		 533 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  60 
 
 		 533 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  60 
 
 		 533 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  59.58 
 
 		 544 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  57.1 
 
 		 534 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  57.88 
 
 		 534 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  57.58 
 
 		 534 aa  330  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  58.18 
 
 		 534 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.5 
 
 		 539 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  47.73 
 
 		 538 aa  262  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  48.19 
 
 		 546 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  48.05 
 
 		 538 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  45.05 
 
 		 539 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  41.74 
 
 		 321 aa  238  9e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  41.74 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  40.31 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  45.45 
 
 		 575 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  46.57 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  46.27 
 
 		 334 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  43.73 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  43.8 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  39.41 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  38.41 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  39.07 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  37.15 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  31.15 
 
 		 345 aa  155  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  35.81 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  30.15 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  33.12 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  31.34 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  31.89 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.29 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  31 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.11 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  33.03 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  27.64 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  31.01 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  28.92 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  31.6 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  31.1 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  30.68 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  28.86 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  25.37 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  25.62 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.76 
 
 		 540 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  26.79 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.79 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  27.96 
 
 		 544 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  29.71 
 
 		 551 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  29.25 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.34 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  24.31 
 
 		 324 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  29.15 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.62 
 
 		 557 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  25.62 
 
 		 409 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.49 
 
 		 543 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 543 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.82 
 
 		 559 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1505  molybdopterin molybdochelatase  33.86 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.265063  normal  0.741192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  32.59 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1840  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  36.56 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4674  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  34 
 
 		 408 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0178  molybdenum cofactor synthesis domain protein  27.86 
 
 		 546 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.876746  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1824  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.82 
 
 		 407 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>