69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0985 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  100 
 
 
336 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  93.15 
 
 
336 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  93.15 
 
 
336 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  68.56 
 
 
348 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  67.87 
 
 
342 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  65.17 
 
 
341 aa  352  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  58.79 
 
 
533 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  59.7 
 
 
533 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  57.4 
 
 
534 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  58.68 
 
 
544 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  57.88 
 
 
533 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  58.18 
 
 
534 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  57.88 
 
 
534 aa  335  7e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  57.27 
 
 
534 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.2 
 
 
539 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  46.53 
 
 
538 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  48.35 
 
 
538 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  48.19 
 
 
546 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  45.05 
 
 
539 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  42.37 
 
 
321 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  42.37 
 
 
401 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  41.88 
 
 
319 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  43.7 
 
 
575 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  43.02 
 
 
334 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  43.29 
 
 
337 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  42.44 
 
 
334 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  43.52 
 
 
357 aa  202  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  41.12 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  39.12 
 
 
333 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  39.07 
 
 
329 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  37.77 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  37.42 
 
 
332 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  38.08 
 
 
330 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  31.4 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  30.43 
 
 
345 aa  149  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  31.83 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  31.64 
 
 
340 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  31.91 
 
 
339 aa  142  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  31.89 
 
 
340 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.07 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  31.43 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  28.31 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  33.03 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  29.45 
 
 
340 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  30.38 
 
 
346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.78 
 
 
341 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  31.19 
 
 
330 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  28.61 
 
 
343 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.38 
 
 
337 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  27.38 
 
 
337 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  30.43 
 
 
339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  24.78 
 
 
341 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  25.31 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.5 
 
 
540 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  27.66 
 
 
544 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  29.41 
 
 
551 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  25.15 
 
 
324 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.72 
 
 
547 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  28.36 
 
 
344 aa  102  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.22 
 
 
557 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  28.47 
 
 
342 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  25.98 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  30.84 
 
 
543 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.41 
 
 
559 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.3 
 
 
543 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1894  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  31 
 
 
640 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.116253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  32.59 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0178  molybdenum cofactor synthesis domain protein  27.86 
 
 
546 aa  43.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.876746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1505  molybdopterin molybdochelatase  32.81 
 
 
400 aa  42.7  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.265063  normal  0.741192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>