207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0997 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 
340 aa  687    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  76.4 
 
 
340 aa  535  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  64.01 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  59.71 
 
 
345 aa  441  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  57.06 
 
 
341 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  59.71 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  60 
 
 
339 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  57.82 
 
 
340 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  55.06 
 
 
347 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  55.1 
 
 
344 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  51.63 
 
 
341 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  49.41 
 
 
340 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  53.94 
 
 
346 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  47.2 
 
 
337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  47.2 
 
 
337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  47.49 
 
 
343 aa  342  5e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  45.59 
 
 
341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  46.2 
 
 
335 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  45.87 
 
 
330 aa  298  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  44.92 
 
 
324 aa  275  6e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  41.86 
 
 
540 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  51.28 
 
 
409 aa  268  8.999999999999999e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  40.35 
 
 
557 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  41.76 
 
 
344 aa  262  4.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.54 
 
 
547 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.71 
 
 
543 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  38.89 
 
 
544 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  38.73 
 
 
551 aa  248  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  39.69 
 
 
324 aa  246  4e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  39.36 
 
 
543 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.94 
 
 
559 aa  245  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  36.42 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  35.05 
 
 
329 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  33.43 
 
 
330 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  31.17 
 
 
342 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  30.63 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  29.85 
 
 
544 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.35 
 
 
533 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.96 
 
 
539 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.91 
 
 
534 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.03 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  30.13 
 
 
539 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  31.5 
 
 
546 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.45 
 
 
534 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  30.5 
 
 
534 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.97 
 
 
533 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.53 
 
 
534 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  30.65 
 
 
348 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  31.04 
 
 
341 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.97 
 
 
538 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  30.65 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  29.81 
 
 
538 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  32.23 
 
 
336 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  31.89 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  31.89 
 
 
336 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  25.78 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  28.31 
 
 
337 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  25.78 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  28.75 
 
 
357 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  24.69 
 
 
333 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  23.84 
 
 
319 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  26.98 
 
 
575 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  27.91 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  27.91 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  27.22 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1334  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  26.28 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2525  molybdenum cofactor synthesis domain protein  38.05 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2621  molybdenum cofactor synthesis domain protein  38.05 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0293542  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1239  molybdopterin binding domain protein  32.58 
 
 
412 aa  57  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.382027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2433  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  32.79 
 
 
388 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.190563 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1699  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  27.27 
 
 
616 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24910  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  26.42 
 
 
405 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  27.44 
 
 
403 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1313  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.82 
 
 
397 aa  53.9  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  36.67 
 
 
421 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  36.67 
 
 
421 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4093  molybdopterin binding domain-containing protein  28.12 
 
 
406 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  35.56 
 
 
421 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2130  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  26.42 
 
 
405 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4037  molybdopterin adenylyltransferase  28.08 
 
 
197 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.676409  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2674  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoeA2  30 
 
 
397 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3069  molybdenum cofactor synthesis domain protein  27.4 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20000  molybdopterin adenylyltransferase  38.67 
 
 
160 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0107152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  39.29 
 
 
426 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  35 
 
 
430 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1840  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  29.03 
 
 
404 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3002  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  26.49 
 
 
424 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0854249  hitchhiker  0.0000143204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  36.25 
 
 
422 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1745  molybdopterin molybdochelatase  27.05 
 
 
404 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1975  molybdopterin binding domain-containing protein  26.35 
 
 
618 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0210  molybdenum cofactor synthesis domain protein  29.01 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101609  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0347  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  26.57 
 
 
616 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6966  molybdopterin binding protein, MoeA  27.12 
 
 
404 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24600  molybdenum cofactor synthesis domain protein  24.87 
 
 
401 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.306259  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1664  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.85 
 
 
405 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869903  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4495  molybdopterin molybdochelatase  25.93 
 
 
402 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0161  molybdopterin binding domain-containing protein  27.15 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0992  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  25.52 
 
 
404 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  35 
 
 
422 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1564  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  26.9 
 
 
616 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.292001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>