More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1745 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1745  molybdopterin molybdochelatase  100 
 
 
404 aa  791    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2123  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  77.78 
 
 
408 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3618  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  77.78 
 
 
405 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649315  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1664  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  77.27 
 
 
405 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869903  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2137  molybdenum cofactor biosynthesis protein  75.76 
 
 
403 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.347838  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1640  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  78.54 
 
 
405 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2353  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  74.75 
 
 
403 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2130  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  75.5 
 
 
405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24910  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  74.75 
 
 
405 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14130  Molybdenum cofactor biosynthesis protein, MoeA  74.24 
 
 
401 aa  562  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3960  molybdopterin molybdochelatase  72.98 
 
 
405 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2151  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  66.17 
 
 
401 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1025  molybdopterin molybdochelatase  53.89 
 
 
397 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0479  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  49.88 
 
 
404 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.636707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2193  MoeA-likedomain-containing protein  50.37 
 
 
424 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00138326  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1544  putative molybdopterin biosynthesis moea protein  52.71 
 
 
404 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571216  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2228  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  50.53 
 
 
419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  hitchhiker  0.00115027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5216  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  51.17 
 
 
411 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.535606  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3203  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  51.43 
 
 
414 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802141  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2022  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  49.28 
 
 
436 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2666  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  47.9 
 
 
428 aa  329  6e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.822327  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2556  molybdenum cofactor synthesis domain protein  51.3 
 
 
414 aa  329  6e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1241  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  51.09 
 
 
419 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1266  molybdenum cofactor synthesis domain protein  47.51 
 
 
419 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.997762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2525  molybdenum cofactor synthesis domain protein  49 
 
 
401 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0933  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  47.1 
 
 
431 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.804892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1915  MoeA-likedomain-containing protein  48.92 
 
 
428 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0440  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  46.38 
 
 
413 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2430  molybdopterin molybdochelatase  46.08 
 
 
418 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1783  molybdopterin molybdochelatase  47.77 
 
 
402 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.648634 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6227  MoeA-likedomain-containing protein  49.21 
 
 
415 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1852  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  49.21 
 
 
415 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1876  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  49.21 
 
 
415 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615539  hitchhiker  0.000063352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1205  molybdenum cofactor synthesis domain protein  46.56 
 
 
419 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.0799464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2379  molybdenum cofactor biosynthesis protein  48.54 
 
 
418 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2394  molybdopterin biosynthesis moeA protein  46.12 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2229  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoeA  46.12 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2267  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoeA  46.12 
 
 
432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2222  molybdopterin molybdochelatase  47.7 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13280  molybdenum cofactor biosynthetic protein A1  51.11 
 
 
407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1382  molybdopterin biosynthesis moeA protein  45.87 
 
 
442 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0024  molybdopterin biosynthesis moeA protein  45.87 
 
 
430 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2359  molybdopterin molybdochelatase  44.47 
 
 
410 aa  312  7.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348804  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1144  molybdopterin biosynthesis moeA protein  45.87 
 
 
430 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1872  molybdopterin biosynthesis moeA protein  45.87 
 
 
432 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5153  molybdopterin binding protein, MoeA  49.74 
 
 
415 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1421  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  50.65 
 
 
426 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162468  normal  0.0104604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1762  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  50.26 
 
 
415 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1330  putative molybdopterin biosynthesis MOEA protein  47.94 
 
 
419 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237789  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0161  molybdopterin binding domain-containing protein  42.82 
 
 
401 aa  308  9e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1194  molybdenum cofactor biosynthetic protein A1  51.6 
 
 
407 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.185603  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1790  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  49.48 
 
 
415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1808  molybdenum cofactor synthesis domain protein  47.04 
 
 
429 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214196  normal  0.0377835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2200  molybdopterin biosynthesis moeA protein  45.48 
 
 
560 aa  300  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.02151  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1834  molybdenum cofactor synthesis domain protein  49.23 
 
 
413 aa  299  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1991  molybdopterin binding domain-containing protein  48.04 
 
 
413 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1964  MoeA-likedomain-containing protein  47.06 
 
 
411 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000165259  normal  0.334989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3130  MoeA-likedomain-containing protein  44.56 
 
 
418 aa  292  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.500647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1313  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  44.19 
 
 
397 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2452  molybdenum cofactor synthesis domain protein  49.37 
 
 
410 aa  279  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1920  MoeA-like protein  46.13 
 
 
396 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3751  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  44.36 
 
 
419 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1547  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.72 
 
 
412 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2966  molybdenum cofactor synthesis domain protein  46.82 
 
 
416 aa  275  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0589  molybdenum cofactor synthesis domain protein  44.9 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.797948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4769  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  40.1 
 
 
414 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000168017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3074  molybdenum cofactor synthesis domain protein  47.04 
 
 
416 aa  272  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0128  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  44.38 
 
 
414 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1489  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  46.02 
 
 
411 aa  265  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4377  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  40.05 
 
 
414 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0242  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  43.72 
 
 
421 aa  263  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0446176  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0887  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.52 
 
 
411 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2848  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  47.69 
 
 
416 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0997  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.52 
 
 
411 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.509905  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0976  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.52 
 
 
411 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0914  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.52 
 
 
411 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0947  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.52 
 
 
411 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0977  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.34 
 
 
411 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0885  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.34 
 
 
411 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2521  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.34 
 
 
411 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0114  MoeA-likedomain-containing protein  41.06 
 
 
415 aa  260  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2815  molybdenum cofactor synthesis domain protein  47.34 
 
 
411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0437851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0852  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.34 
 
 
411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0135  molybdenum cofactor synthesis domain protein  41.06 
 
 
417 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0898  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.02 
 
 
411 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1527  molybdenum cofactor synthesis domain protein  41.4 
 
 
415 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00794  molybdopterin biosynthesis protein  47.02 
 
 
411 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0136  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  40.82 
 
 
417 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00811  hypothetical protein  47.02 
 
 
411 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6175  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  43.01 
 
 
418 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.911345 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2817  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.02 
 
 
411 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2537  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  39.52 
 
 
415 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0131  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  40.92 
 
 
417 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2578  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  44.58 
 
 
424 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2480  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  44.58 
 
 
424 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2976  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  44.77 
 
 
411 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0976  molybdenum cofactor synthesis domain protein  42.78 
 
 
426 aa  256  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4223  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  40.68 
 
 
417 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0097  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  40.78 
 
 
417 aa  255  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.912543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3002  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  39.42 
 
 
424 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0854249  hitchhiker  0.0000143204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>