164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1824 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  100 
 
 
346 aa  690    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  60 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  59.18 
 
 
340 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  59.77 
 
 
339 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  54.97 
 
 
340 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  57.23 
 
 
340 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  55.26 
 
 
345 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  57.14 
 
 
341 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  53.94 
 
 
340 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  50.29 
 
 
340 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  49.71 
 
 
341 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  50.15 
 
 
341 aa  359  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  49.71 
 
 
341 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  47.51 
 
 
337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  47.21 
 
 
337 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  47.69 
 
 
344 aa  322  7e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  44.31 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  45.95 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  44.88 
 
 
330 aa  289  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  47.06 
 
 
344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  42.86 
 
 
324 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  42.74 
 
 
540 aa  270  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  40.35 
 
 
551 aa  256  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  38.84 
 
 
324 aa  245  6e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  39.47 
 
 
544 aa  242  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.33 
 
 
559 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.22 
 
 
547 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.93 
 
 
557 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  39.65 
 
 
339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.65 
 
 
543 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  44.83 
 
 
409 aa  229  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  38.44 
 
 
543 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  35.03 
 
 
329 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  34.5 
 
 
332 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  29.24 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  34.03 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  32.81 
 
 
534 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.76 
 
 
533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.06 
 
 
534 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  32.13 
 
 
544 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.07 
 
 
538 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.27 
 
 
533 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  32.92 
 
 
342 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.45 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  31.15 
 
 
534 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  33.13 
 
 
546 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.72 
 
 
539 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.64 
 
 
534 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  29.97 
 
 
336 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  30.38 
 
 
336 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  30.09 
 
 
336 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  31.29 
 
 
348 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  27.85 
 
 
401 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  28.66 
 
 
539 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  27.76 
 
 
321 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  27.15 
 
 
319 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  30.09 
 
 
334 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  29.79 
 
 
334 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  31.31 
 
 
341 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  29.51 
 
 
575 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  27.83 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  30.65 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.75 
 
 
538 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  28.27 
 
 
357 aa  92.8  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  25.87 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1334  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  36.59 
 
 
394 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0230  molybdopterin molybdochelatase  32.89 
 
 
421 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2525  molybdenum cofactor synthesis domain protein  37.29 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2621  molybdenum cofactor synthesis domain protein  37.29 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0293542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2242  molybdenum cofactor synthesis domain protein  30.15 
 
 
417 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1286  molybdopterin molybdochelatase  28.26 
 
 
403 aa  53.1  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.724523  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1505  molybdopterin molybdochelatase  30.92 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.265063  normal  0.741192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2130  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  28.4 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2137  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.25 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.347838  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2433  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  35.9 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.190563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  29.14 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  35.9 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  40.96 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24910  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  27.78 
 
 
405 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09038  molybdenum cofactor biosynthesis protein (MoeA), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15170)  28.57 
 
 
442 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2123  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  28.9 
 
 
408 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4686  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.85 
 
 
396 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917234  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  35.9 
 
 
422 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3618  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  28.9 
 
 
405 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649315  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  34.62 
 
 
430 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1313  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.33 
 
 
397 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0056  MoeA domain protein domain I and II  32.05 
 
 
432 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  35.9 
 
 
447 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20000  molybdopterin adenylyltransferase  31.58 
 
 
160 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0107152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  32.93 
 
 
421 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  32.93 
 
 
421 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2298  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.64 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2340  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.64 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1664  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  28.32 
 
 
405 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869903  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2956  molybdenum cofactor synthesis domain protein  27.06 
 
 
163 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4093  molybdopterin binding domain-containing protein  26.57 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439954  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0767  molybdopterin molybdochelatase  28.24 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1693  molybdopterin biosynthesis protein  27.7 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0343522  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0034  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.39 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  31.71 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>