209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1478 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 
341 aa  689    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  56.64 
 
 
337 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  56.05 
 
 
337 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  52.79 
 
 
340 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  49.71 
 
 
346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  47.06 
 
 
347 aa  352  8e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  48.97 
 
 
341 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  48.39 
 
 
339 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  48.53 
 
 
340 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.75 
 
 
341 aa  332  8e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  46.31 
 
 
340 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  45.72 
 
 
345 aa  329  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  45.59 
 
 
340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  47.8 
 
 
340 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  45 
 
 
341 aa  322  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  47.89 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  49.69 
 
 
324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  49.12 
 
 
344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  43.99 
 
 
343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  43.31 
 
 
344 aa  305  9.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  43.48 
 
 
330 aa  279  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.47 
 
 
557 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  44.86 
 
 
324 aa  268  8e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.66 
 
 
547 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  40.71 
 
 
544 aa  255  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.65 
 
 
540 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  39.17 
 
 
339 aa  247  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.64 
 
 
559 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  37.39 
 
 
551 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.71 
 
 
543 aa  239  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  45.49 
 
 
409 aa  235  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  37.79 
 
 
543 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  31.53 
 
 
329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  31.66 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  28.48 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  32.63 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  28.16 
 
 
544 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.03 
 
 
538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.71 
 
 
533 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.41 
 
 
533 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.86 
 
 
538 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.41 
 
 
533 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  27.19 
 
 
539 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  26.97 
 
 
534 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  26.75 
 
 
534 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.79 
 
 
534 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  26.61 
 
 
401 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  26.61 
 
 
321 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  26.36 
 
 
534 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  28.24 
 
 
575 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  25.45 
 
 
546 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.39 
 
 
539 aa  96.3  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  25.22 
 
 
348 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  25.07 
 
 
336 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  25.37 
 
 
336 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  23.99 
 
 
319 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  24.48 
 
 
336 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  25.99 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  24.32 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  24.48 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  24.26 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  24.04 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  24.77 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  25.33 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  24.16 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1334  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  31.67 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2525  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.17 
 
 
389 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1772  molybdenum cofactor synthesis domain protein  26.04 
 
 
649 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24910  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  27.44 
 
 
405 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2621  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.3 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0293542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2137  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.12 
 
 
403 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.347838  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2130  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  27.44 
 
 
405 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0178  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.19 
 
 
546 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.876746  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6966  molybdopterin binding protein, MoeA  24.57 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1505  molybdopterin molybdochelatase  31.21 
 
 
400 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.265063  normal  0.741192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 
422 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0347  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  30.57 
 
 
616 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0767  molybdopterin molybdochelatase  29.45 
 
 
411 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2433  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  28.95 
 
 
388 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.190563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2506  molybdenum cofactor synthesis domain protein  29.79 
 
 
395 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  0.418536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  32.5 
 
 
430 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  33.75 
 
 
421 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20000  molybdopterin adenylyltransferase  28.46 
 
 
160 aa  53.1  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0107152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  33.75 
 
 
421 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0920  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  28.57 
 
 
644 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0353995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2123  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  26.2 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2242  molybdenum cofactor synthesis domain protein  23.49 
 
 
417 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  32.5 
 
 
421 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  35.8 
 
 
422 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3618  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.2 
 
 
405 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649315  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1564  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  29.05 
 
 
616 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1664  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  28.17 
 
 
405 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869903  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34190  molybdenum cofactor synthesis domain protein  26.67 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.250612  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4686  molybdenum cofactor synthesis domain protein  27.89 
 
 
396 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917234  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.95 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  31.25 
 
 
426 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1693  molybdopterin biosynthesis protein  27.55 
 
 
401 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0343522  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0671  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/unknown domain fusion protein  29.37 
 
 
549 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00402297 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2055  molybdenum cofactor synthesis protein  26.35 
 
 
163 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2878  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  27.61 
 
 
644 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>