More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3538 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  100 
 
 
341 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  76.99 
 
 
339 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  63.53 
 
 
345 aa  455  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  59.71 
 
 
340 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  59 
 
 
340 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  59.88 
 
 
340 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  58.11 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  57.99 
 
 
347 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  53.53 
 
 
341 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  57.14 
 
 
346 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  56.4 
 
 
344 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  51.18 
 
 
340 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  48.82 
 
 
343 aa  363  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  49.7 
 
 
341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  49.54 
 
 
335 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  44.84 
 
 
337 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  44.84 
 
 
337 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  45 
 
 
341 aa  328  6e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  47.08 
 
 
330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  42.02 
 
 
324 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  44.12 
 
 
344 aa  269  5e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  40.87 
 
 
540 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  40.92 
 
 
324 aa  263  3e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.26 
 
 
547 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  40.18 
 
 
544 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  40.35 
 
 
551 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  45.42 
 
 
409 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  39.12 
 
 
339 aa  245  6e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.59 
 
 
543 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.72 
 
 
559 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.26 
 
 
557 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  39.36 
 
 
543 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  34.14 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  33.03 
 
 
330 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  32.2 
 
 
332 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  32.62 
 
 
544 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  29.84 
 
 
342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  28.05 
 
 
539 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.41 
 
 
533 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.97 
 
 
533 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  34.11 
 
 
336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  34.06 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  34.11 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  30.96 
 
 
546 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  31.25 
 
 
534 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  26.71 
 
 
401 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.96 
 
 
575 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  26.54 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.72 
 
 
534 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  30.41 
 
 
534 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  30.03 
 
 
333 aa  109  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  29.01 
 
 
538 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  31.31 
 
 
348 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.57 
 
 
539 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  33.78 
 
 
336 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.42 
 
 
538 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  32.82 
 
 
341 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.75 
 
 
533 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.88 
 
 
534 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  29.73 
 
 
357 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  27.83 
 
 
337 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  28.48 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  28.4 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  23.22 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  26.15 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1334  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  35.71 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2525  molybdenum cofactor synthesis domain protein  37.19 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2621  molybdenum cofactor synthesis domain protein  38.05 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0293542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2433  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  38.05 
 
 
388 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.190563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 
421 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 
421 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  38.96 
 
 
447 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  35.8 
 
 
421 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  39.51 
 
 
426 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2452  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.36 
 
 
410 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1920  MoeA-like protein  29.03 
 
 
396 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  42.86 
 
 
434 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0992  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.81 
 
 
404 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  35.06 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00794  molybdopterin biosynthesis protein  27.44 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2815  molybdenum cofactor synthesis domain protein  27.44 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0437851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00811  hypothetical protein  27.44 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2277  molybdopterin binding domain-containing protein  29.78 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0898  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  27.44 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0852  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  27.44 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0977  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  27.44 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03854  molybdopterin biosynthesis protein  27.42 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2817  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  27.44 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  33.77 
 
 
422 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0885  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  27.44 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2521  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  27.44 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2151  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  23.75 
 
 
401 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  29.64 
 
 
403 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0148  bifunctional molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MogA  33.73 
 
 
311 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775973  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3002  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  28 
 
 
424 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0854249  hitchhiker  0.0000143204 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2649  molybdopterin molybdochelatase  32 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  33.77 
 
 
422 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14130  Molybdenum cofactor biosynthesis protein, MoeA  31.16 
 
 
401 aa  52.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24910  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  25.85 
 
 
405 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1505  molybdopterin molybdochelatase  30.89 
 
 
400 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.265063  normal  0.741192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>