72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1767 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 357 aa  703    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  55.06 
 
 		 333 aa  335  5.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 334 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  56.51 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  52.69 
 
 		 337 aa  302  7.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  54.82 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.97 
 
 		 539 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  42.19 
 
 		 538 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  44.09 
 
 		 546 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  44.7 
 
 		 348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  43.71 
 
 		 539 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  44.02 
 
 		 544 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.93 
 
 		 538 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  44.67 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  44.96 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  42.32 
 
 		 534 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  38.42 
 
 		 534 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  42.12 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  43.06 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.35 
 
 		 533 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  40.87 
 
 		 534 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  36.97 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.35 
 
 		 533 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.82 
 
 		 533 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.6 
 
 		 534 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  44.09 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  37.65 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  37.65 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  39.09 
 
 		 575 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  37.36 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  35.78 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  38.23 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  31.1 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  29.38 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  31.72 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  28.75 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  30.56 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  28.57 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.57 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  31.29 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  26.82 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  26.79 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  26.51 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 344 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.66 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  27.19 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  29.59 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  27.22 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  30.46 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  29.31 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  28.24 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  27.57 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  27.19 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  29.15 
 
 		 409 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  24.56 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  24.7 
 
 		 324 aa  92  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.64 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  26.27 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.22 
 
 		 540 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  27.48 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.43 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  25.07 
 
 		 551 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  23.71 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.37 
 
 		 559 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  24.57 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0347  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  30.88 
 
 		 616 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1334  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  32.38 
 
 		 394 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2525  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.38 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1062  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  30.26 
 
 		 616 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.92784  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1564  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  30.88 
 
 		 616 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1699  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  30.88 
 
 		 616 aa  42.7  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128773  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4093  molybdopterin binding domain-containing protein  39.02 
 
 		 406 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>