157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1225 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  58.15 
 
 
551 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  100 
 
 
543 aa  1111    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  60.22 
 
 
540 aa  684    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  55.61 
 
 
559 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  55.56 
 
 
547 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  55.39 
 
 
544 aa  588  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  55.13 
 
 
543 aa  591  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  51.47 
 
 
557 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  38.64 
 
 
345 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  39.71 
 
 
340 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.06 
 
 
341 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.94 
 
 
337 aa  259  8e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  38.94 
 
 
337 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  38.24 
 
 
341 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  39.71 
 
 
341 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  41.11 
 
 
344 aa  257  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  38.35 
 
 
340 aa  257  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  39.88 
 
 
340 aa  253  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  39.59 
 
 
341 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  40.12 
 
 
347 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  38.82 
 
 
343 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  39.41 
 
 
340 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  39.65 
 
 
346 aa  243  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  35.86 
 
 
340 aa  243  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  40.24 
 
 
335 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  38.42 
 
 
339 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  37.32 
 
 
344 aa  210  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  35.78 
 
 
330 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  35.49 
 
 
324 aa  206  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  33.33 
 
 
324 aa  203  8e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  36.18 
 
 
339 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  39.21 
 
 
409 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  40.35 
 
 
189 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  30.51 
 
 
329 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  27.91 
 
 
401 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  27.91 
 
 
321 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  27.33 
 
 
342 aa  100  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  29.3 
 
 
332 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  29.61 
 
 
330 aa  94  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0197  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.56 
 
 
182 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.013421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1046  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.99 
 
 
213 aa  86.7  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1309  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  35.15 
 
 
247 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.142506  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  28.99 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.76 
 
 
539 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  27.98 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  27.94 
 
 
575 aa  83.6  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  28.74 
 
 
534 aa  83.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  27.46 
 
 
534 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  25.83 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  28.19 
 
 
534 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.61 
 
 
212 aa  77  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  27.78 
 
 
348 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.92 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  28.14 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  25.47 
 
 
539 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.27 
 
 
533 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.49 
 
 
533 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  23.6 
 
 
538 aa  75.1  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  28.14 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.98 
 
 
538 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  26.77 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  26.02 
 
 
334 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1661  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.02 
 
 
191 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  28.78 
 
 
342 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.29 
 
 
534 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  26.75 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  28.65 
 
 
200 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28 
 
 
194 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.474566  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2569  molybdopterin biosynthesis protein  30.94 
 
 
405 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.635561  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  25.29 
 
 
196 aa  64.3  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  25.61 
 
 
334 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2019  molybdenum cofactor synthesis domain protein  30.99 
 
 
407 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00400246  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  27.3 
 
 
336 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  24.3 
 
 
357 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  27.9 
 
 
341 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1452  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  25.67 
 
 
190 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1824  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.61 
 
 
407 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293219 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0383  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.55 
 
 
191 aa  57  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2125  bifunctional molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MogA  40 
 
 
314 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1529  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.68 
 
 
191 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1920  MoeA-like protein  29.68 
 
 
396 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1641  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  36.9 
 
 
401 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  25.53 
 
 
336 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.05 
 
 
203 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  34.15 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2051  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.05 
 
 
204 aa  51.6  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.887777 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3925  molybdenum cofactor synthesis domain protein  30.67 
 
 
406 aa  50.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1286  molybdopterin molybdochelatase  26.45 
 
 
403 aa  50.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.724523  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.32 
 
 
190 aa  50.4  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1283  molybdenum cofactor synthesis domain protein  25 
 
 
398 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03854  molybdopterin biosynthesis protein  27.7 
 
 
411 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2004  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.87 
 
 
196 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.390285 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1065  bifunctional molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MogA  36.36 
 
 
314 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.63 
 
 
213 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1239  molybdopterin binding domain protein  30.47 
 
 
412 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.382027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1390  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.38 
 
 
414 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  34.07 
 
 
202 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  35.8 
 
 
426 aa  48.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0374  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  28.68 
 
 
632 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.858069  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.66 
 
 
228 aa  47.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>