67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2350 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  100 
 
 		 337 aa  660    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  60.06 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  60.06 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  52.71 
 
 		 357 aa  315  7e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  56.79 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  47.93 
 
 		 333 aa  285  8e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  44.61 
 
 		 544 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  44.94 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  45 
 
 		 539 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  43.66 
 
 		 546 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  42.51 
 
 		 538 aa  229  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.77 
 
 		 539 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.41 
 
 		 538 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.56 
 
 		 533 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.12 
 
 		 533 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  40.47 
 
 		 534 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.18 
 
 		 533 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  43.71 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  44.01 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  40.42 
 
 		 534 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  40.72 
 
 		 534 aa  206  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.69 
 
 		 534 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  42.64 
 
 		 341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  36.73 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  36.73 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  43.41 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  41.02 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  35.09 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  37.43 
 
 		 575 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  36.04 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  28.4 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  34.57 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  28.62 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  30.4 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  28.66 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.38 
 
 		 341 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  27.27 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  28.06 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  26.2 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  27 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  27.88 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  27.49 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  28.83 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  24.39 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  27.01 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  26.49 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  27.8 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.62 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  24.62 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.59 
 
 		 557 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  25 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  25.61 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  23.38 
 
 		 324 aa  86.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.33 
 
 		 540 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.56 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  26.27 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  24.2 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  19.8 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  22.32 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  25.81 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  29.24 
 
 		 543 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.51 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.15 
 
 		 559 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1062  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  22.96 
 
 		 616 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.92784  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0347  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  22 
 
 		 616 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>