64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2150 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  53.96 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2051  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  41.58 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.887777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  40.84 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0860  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.9 
 
 		 192 aa  141  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.41 
 
 		 311 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0346  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.57 
 
 		 174 aa  134  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0788  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.86 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1669  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.9 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  39.89 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0299  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.07 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00199626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0931  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  35.87 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0277  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.07 
 
 		 179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1173  fwdE family protein  36.18 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000142876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0250  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  35.03 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00242591  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0210  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.8 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.264518 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  38.78 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1690  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.28 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0813  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.27 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  37 
 
 		 180 aa  124  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  34.2 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.32 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0146  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.38 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0329177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1104  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  37.89 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0994  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.42 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.588329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2088  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.51 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000187806  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1094  hypothetical protein  30.26 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1159  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  32.14 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1329  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30 
 
 		 270 aa  96.7  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080332  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.15 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.47 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2004  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.38 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.390285 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.86 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0503  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  30.95 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3700  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.37 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.53 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0219  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.35 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.459295 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1664  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.16 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1508  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.21 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0156  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E  31.55 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  30.57 
 
 		 543 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.32 
 
 		 547 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 544 aa  61.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.76 
 
 		 559 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.94 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0360  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.16 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0124463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.56 
 
 		 540 aa  55.5  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  26.23 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.76 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  23.44 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0774  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like  35.4 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2992  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.73 
 
 		 152 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.05 
 
 		 543 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2175  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.8 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  hitchhiker  0.00000414509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  34.09 
 
 		 551 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  30.21 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3664  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.56 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.985424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272508  hitchhiker  0.00939532 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like  34.09 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.563765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.93 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.474566  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1046  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  31.87 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1096  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1529  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.42 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  35.62 
 
 		 272 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>