51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1795 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272508  hitchhiker  0.00939532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2175  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  83.42 
 
 		 230 aa  331  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  hitchhiker  0.00000414509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3664  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  70.43 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.985424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0503  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  41.85 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2004  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  34.2 
 
 		 196 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.390285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.24 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1664  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  34.78 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.15 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1508  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.59 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3700  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  35.64 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0156  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E  34.97 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.39 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.18 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  30.3 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.84 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.24 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.89 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  26.09 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1329  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.95 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080332  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0250  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.84 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00242591  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2051  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.7 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.887777 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1690  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  22.92 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0788  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  23.96 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1104  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.57 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0219  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.15 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.459295 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0210  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  22.4 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.264518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0931  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  25.87 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0146  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  23.56 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0329177  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1159  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  28.12 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.83 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0299  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.4 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00199626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0277  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.4 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  25.65 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1669  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  24.55 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  27.66 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0346  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.67 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0774  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like  32.38 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0813  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.72 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like  29.13 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.563765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0360  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.08 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0124463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1094  hypothetical protein  21.28 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2088  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.09 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000187806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0860  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  20.86 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  23.47 
 
 		 311 aa  44.7  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1096  hypothetical protein  27.56 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  22.55 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1173  fwdE family protein  22.83 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000142876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0994  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.47 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.588329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.18 
 
 		 189 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.85 
 
 		 547 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>