56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0994 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0994  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  100 
 
 		 178 aa  370  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.588329  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1173  fwdE family protein  51.48 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000142876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0813  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  51.48 
 
 		 175 aa  175  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0277  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  47.62 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0299  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  47.59 
 
 		 176 aa  170  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00199626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0346  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  46.75 
 
 		 174 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  48.43 
 
 		 311 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2088  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  45.29 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000187806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  41.71 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2051  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  40.1 
 
 		 204 aa  137  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.887777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1669  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.14 
 
 		 223 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  38.92 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0931  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  37.7 
 
 		 213 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.2 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1094  hypothetical protein  39.15 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  36.52 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0788  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.33 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686177  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1690  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.33 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  34.57 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0210  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.33 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.264518 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0146  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.11 
 
 		 192 aa  120  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0329177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.42 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1159  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  36.7 
 
 		 194 aa  117  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.08 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  35.75 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0250  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  37.5 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00242591  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1104  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  36.9 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0860  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.44 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109987  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.37 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.07 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0503  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  30.81 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0219  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  26.63 
 
 		 238 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.459295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2004  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  31.4 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.390285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3700  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.61 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1508  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.67 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.74 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1664  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.49 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1329  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  25.14 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080332  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3664  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.09 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.985424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0156  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E  35.96 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0360  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.11 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0124463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34 
 
 		 540 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.36 
 
 		 547 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.71 
 
 		 559 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0774  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like  26.72 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  36.46 
 
 		 543 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.75 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.7 
 
 		 557 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 544 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  32.61 
 
 		 551 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2175  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  24.86 
 
 		 230 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  hitchhiker  0.00000414509 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.06 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.7 
 
 		 543 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  29.47 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272508  hitchhiker  0.00939532 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  25.14 
 
 		 196 aa  42  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>