210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0906 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  100 
 
 		 782 aa  1628    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  34.25 
 
 		 799 aa  439  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  33.21 
 
 		 846 aa  422  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  32.08 
 
 		 847 aa  416  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  30.81 
 
 		 847 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  32.33 
 
 		 785 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  32.49 
 
 		 786 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  32.25 
 
 		 802 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  31.28 
 
 		 987 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  32.59 
 
 		 786 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  29.69 
 
 		 789 aa  385  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  32.62 
 
 		 765 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  32.62 
 
 		 765 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  32.49 
 
 		 765 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  32.49 
 
 		 765 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  32.49 
 
 		 765 aa  379  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  30.57 
 
 		 847 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  32.49 
 
 		 765 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  32.62 
 
 		 765 aa  379  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  32.49 
 
 		 765 aa  379  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  32.04 
 
 		 786 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  32.24 
 
 		 765 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  32.59 
 
 		 807 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  32.09 
 
 		 786 aa  372  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  33.54 
 
 		 818 aa  371  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  31.13 
 
 		 765 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  32.04 
 
 		 796 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  30.35 
 
 		 796 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  29.29 
 
 		 805 aa  361  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  31.21 
 
 		 831 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  31.31 
 
 		 765 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  31.31 
 
 		 765 aa  356  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  29.99 
 
 		 811 aa  353  7e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  29.14 
 
 		 807 aa  350  5e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  30.33 
 
 		 848 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  31.84 
 
 		 810 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  29.26 
 
 		 846 aa  345  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  31.72 
 
 		 810 aa  345  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  30.81 
 
 		 808 aa  344  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  31.72 
 
 		 810 aa  344  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  32.03 
 
 		 810 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  31.59 
 
 		 810 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  31.59 
 
 		 810 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  29.05 
 
 		 808 aa  343  7e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  31.59 
 
 		 810 aa  343  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  31.47 
 
 		 810 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  31.59 
 
 		 810 aa  342  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  30.61 
 
 		 834 aa  340  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  29.89 
 
 		 825 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  31.34 
 
 		 810 aa  337  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  31.34 
 
 		 810 aa  337  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  31.34 
 
 		 810 aa  336  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  31.34 
 
 		 810 aa  336  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  31.22 
 
 		 810 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  30.45 
 
 		 828 aa  330  8e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  30.6 
 
 		 810 aa  329  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  28.48 
 
 		 847 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  28.84 
 
 		 823 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  30.64 
 
 		 829 aa  326  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  30.07 
 
 		 828 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  29.53 
 
 		 831 aa  324  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  27.85 
 
 		 848 aa  323  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  29.45 
 
 		 830 aa  323  8e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  33.39 
 
 		 867 aa  323  9.000000000000001e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  27.59 
 
 		 848 aa  320  7e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  29.51 
 
 		 826 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  30.96 
 
 		 811 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  29.41 
 
 		 817 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  31.9 
 
 		 518 aa  233  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  26.6 
 
 		 768 aa  188  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  24.81 
 
 		 739 aa  148  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  27.08 
 
 		 752 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  23 
 
 		 862 aa  140  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  25.05 
 
 		 749 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36056  predicted protein  25.95 
 
 		 738 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  23.62 
 
 		 742 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1694  formate acetyltransferase  25.22 
 
 		 760 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0125988  hitchhiker  0.00465179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2671  formate acetyltransferase  25.22 
 
 		 760 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2690  formate acetyltransferase  25.22 
 
 		 760 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.87079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2769  formate acetyltransferase  25.22 
 
 		 760 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.664167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  26.01 
 
 		 742 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  25.19 
 
 		 756 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1546  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1351 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3307  formate acetyltransferase  24.41 
 
 		 761 aa  134  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1729  formate acetyltransferase  24.19 
 
 		 760 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2378  formate acetyltransferase  25.09 
 
 		 760 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.499739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1672  formate acetyltransferase  24.64 
 
 		 760 aa  131  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114365  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1997  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 760 aa  130  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1136  formate acetyltransferase  24.24 
 
 		 774 aa  130  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.678757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1702  formate acetyltransferase  24.86 
 
 		 760 aa  130  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.548402 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  23.84 
 
 		 755 aa  130  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  25 
 
 		 749 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  24.83 
 
 		 760 aa  130  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1555  formate acetyltransferase  24.55 
 
 		 760 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.306811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16330  formate acetyltransferase 1  25.19 
 
 		 759 aa  128  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  25.23 
 
 		 744 aa  129  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  25.23 
 
 		 744 aa  129  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1498  formate C-acetyltransferase  24.32 
 
 		 760 aa  129  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2243  formate acetyltransferase  24.1 
 
 		 760 aa  129  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1561  formate acetyltransferase  24.55 
 
 		 760 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.404679  normal  0.16507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>