211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2965 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  65.46 
 
 		 786 aa  1095    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  54.88 
 
 		 811 aa  930    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  65.31 
 
 		 796 aa  1085    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  100 
 
 		 785 aa  1638    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  56.74 
 
 		 786 aa  963    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  59.59 
 
 		 786 aa  998    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  64.76 
 
 		 786 aa  1092    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  38.98 
 
 		 799 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  36.26 
 
 		 847 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  35.5 
 
 		 846 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  35.92 
 
 		 802 aa  490  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  36.02 
 
 		 846 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  36.01 
 
 		 765 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  35.92 
 
 		 765 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  35.88 
 
 		 765 aa  465  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  35.88 
 
 		 765 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  35.88 
 
 		 765 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  35.86 
 
 		 765 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  35.88 
 
 		 765 aa  465  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  35.76 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  35.76 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  33.92 
 
 		 847 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  33.8 
 
 		 847 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  34.67 
 
 		 796 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  34.88 
 
 		 818 aa  456  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  33.67 
 
 		 765 aa  459  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  35.18 
 
 		 848 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  35.64 
 
 		 808 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  35.16 
 
 		 765 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  35.16 
 
 		 765 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  32.92 
 
 		 823 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  34.94 
 
 		 848 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  35.01 
 
 		 807 aa  442  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  33.66 
 
 		 810 aa  439  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  35.66 
 
 		 826 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  34.97 
 
 		 848 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  33.37 
 
 		 825 aa  435  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  34.54 
 
 		 808 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  34.51 
 
 		 829 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  34.24 
 
 		 847 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  33.96 
 
 		 810 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  33.83 
 
 		 810 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  33 
 
 		 828 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  34.25 
 
 		 831 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  33.21 
 
 		 810 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  32.36 
 
 		 789 aa  425  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  33.08 
 
 		 810 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  33.08 
 
 		 810 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  34.2 
 
 		 828 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  33.08 
 
 		 810 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  33.71 
 
 		 810 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  32.96 
 
 		 810 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  33.58 
 
 		 810 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  33.33 
 
 		 830 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  33.58 
 
 		 810 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  33.58 
 
 		 810 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  32.84 
 
 		 810 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  33.83 
 
 		 810 aa  422  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  33.5 
 
 		 831 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  32.04 
 
 		 807 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  32.62 
 
 		 805 aa  418  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  33.42 
 
 		 810 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  34.2 
 
 		 834 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  32.33 
 
 		 782 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  33.17 
 
 		 817 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  31.51 
 
 		 811 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  28.78 
 
 		 987 aa  330  7e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  35.99 
 
 		 518 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  30.9 
 
 		 867 aa  296  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  28.97 
 
 		 862 aa  283  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  28.72 
 
 		 768 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  26.16 
 
 		 749 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  27.08 
 
 		 742 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  26.34 
 
 		 742 aa  174  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  25.98 
 
 		 739 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  24.55 
 
 		 756 aa  172  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  25.36 
 
 		 749 aa  171  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  25.65 
 
 		 742 aa  170  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  26.67 
 
 		 754 aa  169  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1895  formate acetyltransferase  25.44 
 
 		 753 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  24.15 
 
 		 749 aa  165  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  24.49 
 
 		 749 aa  165  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  26.47 
 
 		 756 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  24.34 
 
 		 760 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  24.44 
 
 		 749 aa  163  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  24.44 
 
 		 749 aa  163  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  24.67 
 
 		 749 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2224  formate acetyltransferase  25.44 
 
 		 742 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000796506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  24.67 
 
 		 749 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  24.44 
 
 		 748 aa  162  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  24.53 
 
 		 749 aa  161  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  24.53 
 
 		 749 aa  161  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  24.53 
 
 		 749 aa  161  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  24.53 
 
 		 749 aa  160  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36056  predicted protein  25.04 
 
 		 738 aa  160  8e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  24.53 
 
 		 749 aa  160  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  24.38 
 
 		 749 aa  159  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  26.55 
 
 		 752 aa  157  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1080  formate acetyltransferase  25.37 
 
 		 759 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  25.82 
 
 		 744 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>