192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2366 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  61.95 
 
 
786 aa  1016    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  54.71 
 
 
796 aa  921    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  72.19 
 
 
786 aa  1196    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  50.57 
 
 
811 aa  821    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  61.17 
 
 
786 aa  1015    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  59.59 
 
 
785 aa  998    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  100 
 
 
786 aa  1639    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  36.26 
 
 
799 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  33.45 
 
 
847 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  34.18 
 
 
796 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  33.08 
 
 
802 aa  435  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  33.92 
 
 
846 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  32.71 
 
 
846 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  33.85 
 
 
847 aa  422  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  32.96 
 
 
848 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  33.75 
 
 
810 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  33.83 
 
 
823 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  32.87 
 
 
847 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  33.66 
 
 
848 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  33.5 
 
 
831 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  34.05 
 
 
807 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  34.18 
 
 
810 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  32.59 
 
 
830 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  34.13 
 
 
810 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  34.01 
 
 
810 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  32.87 
 
 
789 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  33.46 
 
 
765 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  32.58 
 
 
818 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  34.26 
 
 
810 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  32.75 
 
 
825 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  34.01 
 
 
810 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  33.46 
 
 
765 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  34.12 
 
 
848 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  32.92 
 
 
828 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  34.26 
 
 
810 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  34.38 
 
 
810 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  33.46 
 
 
765 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  34.01 
 
 
810 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  34.01 
 
 
810 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  33.46 
 
 
765 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  33.88 
 
 
810 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  33.38 
 
 
831 aa  398  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  33.88 
 
 
810 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  33.33 
 
 
765 aa  398  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  32.91 
 
 
808 aa  399  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  33.54 
 
 
808 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  33.88 
 
 
810 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  34.13 
 
 
810 aa  398  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  33.5 
 
 
765 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  33.88 
 
 
810 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  33.17 
 
 
765 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  32.03 
 
 
765 aa  395  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  33.17 
 
 
765 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  32.5 
 
 
807 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  33.04 
 
 
765 aa  392  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  31.04 
 
 
805 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  32.11 
 
 
829 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  33 
 
 
765 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  33 
 
 
765 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  32.59 
 
 
834 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  32.47 
 
 
826 aa  376  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  32.04 
 
 
782 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  32.41 
 
 
828 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  31.92 
 
 
817 aa  356  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  29.72 
 
 
987 aa  318  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  35.09 
 
 
518 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  32.37 
 
 
811 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  31.31 
 
 
867 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  30.95 
 
 
847 aa  282  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  27.77 
 
 
862 aa  263  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  30.04 
 
 
768 aa  249  9e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  28.84 
 
 
742 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  27.12 
 
 
742 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  28.14 
 
 
756 aa  173  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36056  predicted protein  25.59 
 
 
738 aa  170  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  26.73 
 
 
742 aa  167  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2224  formate acetyltransferase  27.21 
 
 
742 aa  165  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000796506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  27.08 
 
 
739 aa  162  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  26.39 
 
 
756 aa  160  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1895  formate acetyltransferase  28.1 
 
 
753 aa  160  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349788  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  26.38 
 
 
754 aa  156  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  27.14 
 
 
743 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  25.78 
 
 
749 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  26.79 
 
 
744 aa  154  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  26.79 
 
 
744 aa  154  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  25.18 
 
 
749 aa  153  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  25.15 
 
 
755 aa  152  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  24.86 
 
 
749 aa  152  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  24.82 
 
 
749 aa  151  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  26.75 
 
 
752 aa  151  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  24.82 
 
 
749 aa  151  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  25.05 
 
 
749 aa  149  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  25.05 
 
 
749 aa  149  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  25.14 
 
 
760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  24.86 
 
 
748 aa  148  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  24.45 
 
 
749 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  24.45 
 
 
749 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  24.45 
 
 
749 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  24.45 
 
 
749 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  24.45 
 
 
749 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>