180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0937 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  100 
 
 		 808 aa  1681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  67.3 
 
 		 808 aa  1162    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  66.04 
 
 		 846 aa  1153    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  72.85 
 
 		 831 aa  1278    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  72.09 
 
 		 834 aa  1256    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  75.03 
 
 		 847 aa  1298    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  74.14 
 
 		 848 aa  1273    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  66.79 
 
 		 848 aa  1149    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  66.42 
 
 		 848 aa  1131    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  35.91 
 
 		 799 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  34.28 
 
 		 825 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  34.34 
 
 		 765 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  33.29 
 
 		 765 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  33.65 
 
 		 847 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  34.34 
 
 		 765 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  34.47 
 
 		 830 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  34.34 
 
 		 765 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  34.34 
 
 		 765 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  34.21 
 
 		 765 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  33.42 
 
 		 829 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  34.34 
 
 		 765 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  34.54 
 
 		 785 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  34.38 
 
 		 765 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  34.51 
 
 		 786 aa  432  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  34.34 
 
 		 765 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  33.09 
 
 		 823 aa  429  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  33.58 
 
 		 802 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  34.21 
 
 		 765 aa  428  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  33.95 
 
 		 831 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  34.25 
 
 		 811 aa  424  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  33.54 
 
 		 789 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  34.21 
 
 		 765 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  33.98 
 
 		 828 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  33.42 
 
 		 828 aa  426  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  34.21 
 
 		 765 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  34.33 
 
 		 818 aa  422  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  33.96 
 
 		 826 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  32.47 
 
 		 846 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  32.8 
 
 		 805 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  32.96 
 
 		 786 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  32.91 
 
 		 786 aa  399  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  32 
 
 		 796 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  33.54 
 
 		 807 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  33.17 
 
 		 796 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  31.2 
 
 		 847 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  31.59 
 
 		 847 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  31.44 
 
 		 810 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  31.97 
 
 		 807 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  31.44 
 
 		 810 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  31.44 
 
 		 810 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  31.44 
 
 		 810 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  31.44 
 
 		 810 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  31.21 
 
 		 810 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  31.33 
 
 		 810 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  30.97 
 
 		 810 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  31.09 
 
 		 810 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  31.32 
 
 		 810 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  30.97 
 
 		 810 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  31.09 
 
 		 810 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  30.97 
 
 		 810 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  31.09 
 
 		 810 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  32.03 
 
 		 786 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  31.93 
 
 		 811 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  31.16 
 
 		 810 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  35.86 
 
 		 867 aa  351  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  29.05 
 
 		 782 aa  343  7e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  28.29 
 
 		 987 aa  328  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  27.62 
 
 		 817 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  34.3 
 
 		 518 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  27.92 
 
 		 862 aa  263  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  27.98 
 
 		 768 aa  231  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  26.56 
 
 		 742 aa  154  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  26.45 
 
 		 739 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  24.36 
 
 		 742 aa  145  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02981  pyruvate formate-lyase 4/2-ketobutyrate formate-lyase  25.13 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0589  formate acetyltransferase  25.13 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02932  hypothetical protein  25.13 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3302  formate acetyltransferase  25.13 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.674178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3243  formate acetyltransferase  25.13 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0584  formate acetyltransferase  25.13 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.80085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3410  formate acetyltransferase  25.13 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4427  formate acetyltransferase  25 
 
 		 764 aa  144  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.017664 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  26.86 
 
 		 743 aa  144  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3588  formate acetyltransferase  25.26 
 
 		 764 aa  144  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  25.09 
 
 		 749 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  25.13 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2755  pyruvate-formate lyase  32.32 
 
 		 326 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0853745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02963  pyruvate-formate lyase  24.87 
 
 		 765 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36056  predicted protein  26.84 
 
 		 738 aa  140  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2718  formate acetyltransferase  26.15 
 
 		 742 aa  140  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  24.78 
 
 		 760 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  24.19 
 
 		 749 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  23.5 
 
 		 754 aa  139  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  24.35 
 
 		 752 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 749 aa  138  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 749 aa  138  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  24.01 
 
 		 749 aa  138  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  24.35 
 
 		 749 aa  138  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  24.35 
 
 		 749 aa  138  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 749 aa  138  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>