211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4092 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  49.82 
 
 		 799 aa  806    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  77.33 
 
 		 846 aa  1387    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  75.18 
 
 		 847 aa  1354    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  58.73 
 
 		 847 aa  1037    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  100 
 
 		 847 aa  1777    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  51.45 
 
 		 867 aa  905    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  37.71 
 
 		 765 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  37.71 
 
 		 765 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  37.35 
 
 		 765 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  37.35 
 
 		 765 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  37.35 
 
 		 765 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  37.35 
 
 		 765 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  37.35 
 
 		 765 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  37.47 
 
 		 765 aa  561  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  37.35 
 
 		 765 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  36.68 
 
 		 796 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  35.74 
 
 		 818 aa  546  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  36.22 
 
 		 765 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  36.22 
 
 		 765 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  36.33 
 
 		 765 aa  520  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  35.24 
 
 		 802 aa  522  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  35.15 
 
 		 807 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  34.16 
 
 		 789 aa  481  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  34.15 
 
 		 805 aa  479  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  33.53 
 
 		 810 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  33.88 
 
 		 810 aa  465  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  33.88 
 
 		 810 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  33.88 
 
 		 810 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  33.68 
 
 		 810 aa  466  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  33.41 
 
 		 810 aa  466  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  33.88 
 
 		 810 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  34.07 
 
 		 810 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  33.22 
 
 		 810 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  33.53 
 
 		 810 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  33.76 
 
 		 810 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  33.76 
 
 		 810 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  33.92 
 
 		 785 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  33.22 
 
 		 810 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  34.16 
 
 		 846 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  34.04 
 
 		 810 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  32.95 
 
 		 810 aa  452  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  33.73 
 
 		 848 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  32.98 
 
 		 807 aa  438  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  32.86 
 
 		 831 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  32.9 
 
 		 848 aa  416  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  30.81 
 
 		 782 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  32.09 
 
 		 825 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  31.22 
 
 		 829 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  32.11 
 
 		 808 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  31.2 
 
 		 808 aa  392  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  30.76 
 
 		 830 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  31.67 
 
 		 834 aa  389  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  31.5 
 
 		 786 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  31.72 
 
 		 828 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  31.34 
 
 		 826 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  31.11 
 
 		 831 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  31.48 
 
 		 796 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  31.23 
 
 		 823 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  36.66 
 
 		 848 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  31.11 
 
 		 786 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  30.19 
 
 		 828 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  30.18 
 
 		 811 aa  368  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  29.82 
 
 		 811 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  34.35 
 
 		 847 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  29.06 
 
 		 817 aa  327  7e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  27.05 
 
 		 987 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  31.64 
 
 		 786 aa  289  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  30.95 
 
 		 786 aa  282  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  30.42 
 
 		 518 aa  254  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  24.82 
 
 		 768 aa  195  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  25.18 
 
 		 862 aa  188  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  26.12 
 
 		 742 aa  155  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1546  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1351 aa  146  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369989 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2755  pyruvate-formate lyase  33.99 
 
 		 326 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0853745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  35.48 
 
 		 749 aa  129  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 742 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  23.08 
 
 		 748 aa  127  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 760 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 749 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 749 aa  126  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  35.48 
 
 		 749 aa  126  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 749 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 749 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  34.95 
 
 		 749 aa  125  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  34.95 
 
 		 749 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 749 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 749 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 749 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 749 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  35.48 
 
 		 754 aa  125  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 756 aa  125  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1080  formate acetyltransferase  37.63 
 
 		 759 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2980  formate acetyltransferase  37.63 
 
 		 758 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.235971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  35.48 
 
 		 752 aa  124  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  36.98 
 
 		 756 aa  124  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1997  formate acetyltransferase  34.55 
 
 		 760 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  34.95 
 
 		 742 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1729  formate acetyltransferase  34.55 
 
 		 760 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2345  formate acetyltransferase  34.55 
 
 		 760 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3208  formate acetyltransferase  36.56 
 
 		 763 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491624  hitchhiker  0.00152355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>