211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0903 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  52.38 
 
 		 799 aa  838    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  100 
 
 		 846 aa  1759    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  87.13 
 
 		 847 aa  1543    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  60.96 
 
 		 847 aa  1075    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  77.33 
 
 		 847 aa  1387    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  52.15 
 
 		 867 aa  926    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  38.04 
 
 		 796 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  37.1 
 
 		 765 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  36.38 
 
 		 802 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  37.22 
 
 		 765 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  35.86 
 
 		 818 aa  549  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  37.09 
 
 		 765 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  37.2 
 
 		 765 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  37.09 
 
 		 765 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  37.32 
 
 		 765 aa  541  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  37.09 
 
 		 765 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  37.09 
 
 		 765 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  37.09 
 
 		 765 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  36.97 
 
 		 765 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  36.7 
 
 		 765 aa  539  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  36.85 
 
 		 765 aa  534  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  35.95 
 
 		 807 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  35.5 
 
 		 785 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  33.56 
 
 		 810 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  34.03 
 
 		 810 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  34.03 
 
 		 810 aa  485  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  33.79 
 
 		 810 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  33.79 
 
 		 810 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  34.5 
 
 		 810 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  34.98 
 
 		 805 aa  484  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  33.8 
 
 		 810 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  34.03 
 
 		 810 aa  485  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  33.8 
 
 		 810 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  33.68 
 
 		 810 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  33.68 
 
 		 810 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  33.8 
 
 		 810 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  33.79 
 
 		 810 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  33.8 
 
 		 810 aa  479  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  33.73 
 
 		 810 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  33.85 
 
 		 789 aa  459  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  33.89 
 
 		 786 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  34.91 
 
 		 846 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  33.06 
 
 		 807 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  33.33 
 
 		 786 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  33.84 
 
 		 848 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  34.24 
 
 		 848 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  32.69 
 
 		 786 aa  429  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  32.71 
 
 		 786 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  33.14 
 
 		 796 aa  426  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  33.25 
 
 		 847 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  33.21 
 
 		 782 aa  422  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  32.5 
 
 		 831 aa  415  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  32.47 
 
 		 808 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  33.37 
 
 		 848 aa  416  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  33.02 
 
 		 834 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  32.75 
 
 		 828 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  32.41 
 
 		 829 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  32.71 
 
 		 825 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  32.27 
 
 		 811 aa  404  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  32.7 
 
 		 808 aa  405  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  31.99 
 
 		 830 aa  405  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  32.87 
 
 		 826 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  31.46 
 
 		 831 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  30.74 
 
 		 823 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  31.74 
 
 		 828 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  31.23 
 
 		 811 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  29.86 
 
 		 817 aa  328  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  27.61 
 
 		 987 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  28.86 
 
 		 518 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  26.61 
 
 		 862 aa  195  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  24.93 
 
 		 768 aa  192  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2755  pyruvate-formate lyase  36 
 
 		 326 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0853745  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1136  formate acetyltransferase  26.17 
 
 		 774 aa  156  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.678757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1546  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1351 aa  153  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  24.37 
 
 		 742 aa  147  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  23.94 
 
 		 749 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  23.76 
 
 		 739 aa  145  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  33.05 
 
 		 742 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2677  formate acetyltransferase  34.45 
 
 		 760 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1946  formate acetyltransferase 1  34.45 
 
 		 760 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218638  normal  0.0948953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2589  formate acetyltransferase  34.45 
 
 		 760 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2345  formate acetyltransferase  34.03 
 
 		 760 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1729  formate acetyltransferase  34.03 
 
 		 760 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1997  formate acetyltransferase  34.03 
 
 		 760 aa  134  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2243  formate acetyltransferase  34.03 
 
 		 760 aa  134  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1006  formate acetyltransferase  34.45 
 
 		 760 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1086  formate acetyltransferase  34.45 
 
 		 760 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0978  formate acetyltransferase  34.45 
 
 		 760 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1037  formate acetyltransferase  34.45 
 
 		 760 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101477  normal  0.620237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1071  formate acetyltransferase  34.45 
 
 		 760 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.54519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1702  formate acetyltransferase  34.58 
 
 		 760 aa  133  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.548402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1672  formate acetyltransferase  24.83 
 
 		 760 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114365  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1423  formate acetyltransferase  34.03 
 
 		 760 aa  132  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003976  pyruvate formate-lyase  35.37 
 
 		 758 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3599  formate acetyltransferase  23.38 
 
 		 764 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3536  formate acetyltransferase  23.38 
 
 		 764 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3432  formate acetyltransferase  23.43 
 
 		 764 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  33.48 
 
 		 749 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3503  formate acetyltransferase  23.43 
 
 		 764 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  36.56 
 
 		 742 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>