180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3278 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  87.85 
 
 		 848 aa  1586    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  64.86 
 
 		 848 aa  1150    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  75.03 
 
 		 808 aa  1298    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  61.32 
 
 		 808 aa  1057    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  65.05 
 
 		 846 aa  1198    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  100 
 
 		 847 aa  1767    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  73.69 
 
 		 831 aa  1298    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  73.85 
 
 		 834 aa  1293    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  66.51 
 
 		 848 aa  1235    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  35.79 
 
 		 799 aa  499  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  35.89 
 
 		 828 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  34.37 
 
 		 830 aa  445  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  34.54 
 
 		 831 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  34.63 
 
 		 825 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  33.61 
 
 		 847 aa  438  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  33.5 
 
 		 765 aa  438  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  34.6 
 
 		 789 aa  439  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  34.34 
 
 		 765 aa  436  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  34.22 
 
 		 765 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  34.8 
 
 		 829 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  34.34 
 
 		 765 aa  436  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  34.22 
 
 		 765 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  34.34 
 
 		 765 aa  436  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  35.1 
 
 		 823 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  34.34 
 
 		 765 aa  436  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  34.22 
 
 		 765 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  34.22 
 
 		 765 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  34.34 
 
 		 765 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  34.34 
 
 		 765 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  34.34 
 
 		 765 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  34.24 
 
 		 785 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  34.38 
 
 		 826 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  33.71 
 
 		 802 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  33.95 
 
 		 828 aa  429  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  33.25 
 
 		 846 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  33.67 
 
 		 786 aa  422  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  32.71 
 
 		 805 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  32.7 
 
 		 847 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  32.87 
 
 		 786 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  33.46 
 
 		 818 aa  405  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  32.92 
 
 		 807 aa  402  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  33.25 
 
 		 811 aa  400  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  31.59 
 
 		 786 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  32.54 
 
 		 786 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  32.28 
 
 		 810 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  32.75 
 
 		 810 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  32.75 
 
 		 810 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  32.75 
 
 		 810 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  32.29 
 
 		 796 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  32.75 
 
 		 810 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  32.25 
 
 		 810 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  32.38 
 
 		 810 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  32.63 
 
 		 810 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  32.63 
 
 		 810 aa  385  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  32.5 
 
 		 810 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  32.13 
 
 		 810 aa  382  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  32.13 
 
 		 810 aa  382  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  32.13 
 
 		 810 aa  382  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  32.13 
 
 		 810 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  30.54 
 
 		 796 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  32.37 
 
 		 810 aa  372  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  31.86 
 
 		 807 aa  364  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  35.37 
 
 		 867 aa  354  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  30.42 
 
 		 811 aa  343  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  34.35 
 
 		 847 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  28.48 
 
 		 782 aa  328  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  29.3 
 
 		 987 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  29.02 
 
 		 817 aa  318  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  38.18 
 
 		 518 aa  313  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  28.11 
 
 		 768 aa  240  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  26.61 
 
 		 862 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  25.89 
 
 		 739 aa  143  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2755  pyruvate-formate lyase  31.65 
 
 		 326 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0853745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  24.5 
 
 		 749 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  25.32 
 
 		 742 aa  132  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  24.77 
 
 		 742 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  25.14 
 
 		 744 aa  127  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  25.14 
 
 		 744 aa  127  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  23.65 
 
 		 760 aa  127  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  25.09 
 
 		 743 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3410  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 764 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02981  pyruvate formate-lyase 4/2-ketobutyrate formate-lyase  24.01 
 
 		 764 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0589  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 764 aa  120  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02932  hypothetical protein  24.01 
 
 		 764 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3302  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 764 aa  120  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.674178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0584  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 764 aa  121  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.80085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3243  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 764 aa  120  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  25.05 
 
 		 752 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4427  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 764 aa  120  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.017664 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  23.77 
 
 		 748 aa  120  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3588  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 764 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2718  formate acetyltransferase  24.14 
 
 		 742 aa  117  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1058  formate acetyltransferase  23.23 
 
 		 745 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003976  pyruvate formate-lyase  23.87 
 
 		 758 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  23.77 
 
 		 742 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3503  formate acetyltransferase  23.37 
 
 		 764 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3536  formate acetyltransferase  23.37 
 
 		 764 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  22.33 
 
 		 749 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  22.33 
 
 		 749 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3599  formate acetyltransferase  23.37 
 
 		 764 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>