211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1397 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  49.82 
 
 		 847 aa  806    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  100 
 
 		 799 aa  1659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  52.38 
 
 		 846 aa  838    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  51.48 
 
 		 847 aa  838    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  53.92 
 
 		 847 aa  875    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  43.35 
 
 		 796 aa  636    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  41.96 
 
 		 818 aa  628  1e-178  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  40.36 
 
 		 765 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  40.23 
 
 		 765 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  40.36 
 
 		 765 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  40.36 
 
 		 765 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  40.36 
 
 		 765 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  40.36 
 
 		 765 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  40.36 
 
 		 765 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  40.36 
 
 		 765 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  40.23 
 
 		 765 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  40.62 
 
 		 802 aa  599  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  41.15 
 
 		 765 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  41.15 
 
 		 765 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  40.66 
 
 		 765 aa  580  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  48.75 
 
 		 867 aa  580  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  38.98 
 
 		 785 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  38.98 
 
 		 810 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  38.98 
 
 		 810 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  38.98 
 
 		 810 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  38.85 
 
 		 810 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  38.98 
 
 		 810 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  39.09 
 
 		 810 aa  558  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  38.96 
 
 		 810 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  38.96 
 
 		 810 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  39.21 
 
 		 810 aa  558  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  38.46 
 
 		 810 aa  557  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  39.09 
 
 		 810 aa  555  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  39.09 
 
 		 810 aa  555  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  38.71 
 
 		 810 aa  554  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  39.5 
 
 		 807 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  38.83 
 
 		 810 aa  552  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  38.78 
 
 		 810 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  39.41 
 
 		 786 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  37.31 
 
 		 789 aa  533  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  38.45 
 
 		 786 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  37.36 
 
 		 805 aa  530  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  37.81 
 
 		 796 aa  531  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  38.32 
 
 		 807 aa  528  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  37.31 
 
 		 848 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  37.31 
 
 		 846 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  36.64 
 
 		 786 aa  513  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  36.05 
 
 		 831 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  36.29 
 
 		 811 aa  503  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  35.91 
 
 		 808 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  36.77 
 
 		 808 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  35.79 
 
 		 847 aa  499  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  36.26 
 
 		 786 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  35.26 
 
 		 834 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  35.79 
 
 		 848 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  37.01 
 
 		 848 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  36.41 
 
 		 825 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  36.3 
 
 		 828 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  35.12 
 
 		 829 aa  446  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  34.25 
 
 		 826 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  34.25 
 
 		 782 aa  439  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  33.37 
 
 		 830 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  34.84 
 
 		 828 aa  435  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  32.76 
 
 		 831 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  34.74 
 
 		 817 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  32.74 
 
 		 811 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  32.75 
 
 		 823 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  28.39 
 
 		 987 aa  354  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  36.56 
 
 		 518 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  28.86 
 
 		 862 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  29.22 
 
 		 768 aa  252  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  25.61 
 
 		 749 aa  205  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  26.24 
 
 		 756 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  27.77 
 
 		 739 aa  201  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  27.33 
 
 		 752 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  27.43 
 
 		 744 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  27.43 
 
 		 744 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  25.55 
 
 		 749 aa  197  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  26.52 
 
 		 760 aa  197  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3429  formate acetyltransferase  26.81 
 
 		 764 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3503  formate acetyltransferase  27.82 
 
 		 764 aa  193  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3432  formate acetyltransferase  26.68 
 
 		 764 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  25.14 
 
 		 749 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  25.17 
 
 		 749 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003976  pyruvate formate-lyase  26.23 
 
 		 758 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2096  formate acetyltransferase  27.35 
 
 		 751 aa  191  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3599  formate acetyltransferase  27.82 
 
 		 764 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3536  formate acetyltransferase  27.82 
 
 		 764 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  25.94 
 
 		 756 aa  191  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  26.57 
 
 		 742 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1729  formate acetyltransferase  27.86 
 
 		 760 aa  189  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  24.9 
 
 		 749 aa  188  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1136  formate acetyltransferase  28.93 
 
 		 774 aa  188  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.678757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1498  formate C-acetyltransferase  26.37 
 
 		 760 aa  188  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3588  formate acetyltransferase  27.73 
 
 		 764 aa  188  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4427  formate acetyltransferase  27.73 
 
 		 764 aa  187  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.017664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1997  formate acetyltransferase  26.71 
 
 		 760 aa  187  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  29.43 
 
 		 742 aa  187  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  28.76 
 
 		 742 aa  187  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  24.97 
 
 		 749 aa  187  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>