180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4905 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  74.14 
 
 		 808 aa  1273    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  61.12 
 
 		 808 aa  1054    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  62.91 
 
 		 846 aa  1159    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  87.85 
 
 		 847 aa  1586    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  100 
 
 		 848 aa  1767    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  63.44 
 
 		 848 aa  1127    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  73.55 
 
 		 834 aa  1264    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  65.09 
 
 		 848 aa  1211    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  72.69 
 
 		 831 aa  1269    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  35.79 
 
 		 799 aa  495  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  35.83 
 
 		 828 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  35.82 
 
 		 825 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  34.73 
 
 		 829 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  34.2 
 
 		 847 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  34.84 
 
 		 826 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  34.94 
 
 		 785 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  33.73 
 
 		 828 aa  439  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  35.26 
 
 		 830 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  34.76 
 
 		 823 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  34.32 
 
 		 831 aa  432  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  33.46 
 
 		 765 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  33.79 
 
 		 789 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  33.71 
 
 		 765 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  33.71 
 
 		 765 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  33.84 
 
 		 765 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  33 
 
 		 802 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  33.71 
 
 		 765 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  33.92 
 
 		 786 aa  422  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  33.71 
 
 		 765 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  33.96 
 
 		 765 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  33.71 
 
 		 765 aa  419  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  33.71 
 
 		 765 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  33.71 
 
 		 765 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  33.96 
 
 		 765 aa  419  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  32.9 
 
 		 847 aa  416  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  33.37 
 
 		 846 aa  416  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  33.59 
 
 		 765 aa  415  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  33.87 
 
 		 818 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  33.7 
 
 		 811 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  33.66 
 
 		 786 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  33.22 
 
 		 847 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  33.91 
 
 		 786 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  32.8 
 
 		 810 aa  405  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  33.21 
 
 		 786 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  32.34 
 
 		 805 aa  402  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  31.75 
 
 		 807 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  32.76 
 
 		 810 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  32.76 
 
 		 810 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  32.76 
 
 		 810 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  32.54 
 
 		 810 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  32.76 
 
 		 810 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  32.64 
 
 		 810 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  33.04 
 
 		 796 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  32.67 
 
 		 810 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  32.84 
 
 		 810 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  32.42 
 
 		 810 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  32.42 
 
 		 810 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  32.67 
 
 		 810 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  32.42 
 
 		 810 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  32.42 
 
 		 810 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  32.71 
 
 		 810 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  31.18 
 
 		 796 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  32.46 
 
 		 807 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  35.71 
 
 		 867 aa  351  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  30.33 
 
 		 782 aa  347  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  30.11 
 
 		 811 aa  344  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  30.15 
 
 		 817 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  29.72 
 
 		 987 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  38.13 
 
 		 518 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  27.05 
 
 		 862 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  28.18 
 
 		 768 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2755  pyruvate-formate lyase  32.65 
 
 		 326 aa  151  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0853745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  25.52 
 
 		 739 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  25.26 
 
 		 742 aa  142  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  24.16 
 
 		 749 aa  137  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  25.76 
 
 		 760 aa  135  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  25 
 
 		 742 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2718  formate acetyltransferase  25.43 
 
 		 742 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  24.14 
 
 		 749 aa  129  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  25.39 
 
 		 743 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02981  pyruvate formate-lyase 4/2-ketobutyrate formate-lyase  26.39 
 
 		 764 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0589  formate acetyltransferase  26.39 
 
 		 764 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4427  formate acetyltransferase  26.39 
 
 		 764 aa  126  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.017664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3302  formate acetyltransferase  26.39 
 
 		 764 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.674178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3243  formate acetyltransferase  26.39 
 
 		 764 aa  126  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02932  hypothetical protein  26.39 
 
 		 764 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0584  formate acetyltransferase  26.39 
 
 		 764 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.80085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3588  formate acetyltransferase  26.39 
 
 		 764 aa  126  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3410  formate acetyltransferase  26.39 
 
 		 764 aa  126  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  25.04 
 
 		 752 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  23.28 
 
 		 749 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  23.28 
 
 		 749 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  23.28 
 
 		 749 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  23.28 
 
 		 749 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  24.73 
 
 		 744 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  24.73 
 
 		 744 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  23.01 
 
 		 749 aa  122  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  23.01 
 
 		 749 aa  122  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1457  formate acetyltransferase  25.04 
 
 		 787 aa  122  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  22.79 
 
 		 748 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>