211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2525 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  99.14 
 
 		 810 aa  1676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  47.28 
 
 		 802 aa  767    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  99.01 
 
 		 810 aa  1674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  71.04 
 
 		 807 aa  1211    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  51.55 
 
 		 818 aa  836    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  96.05 
 
 		 810 aa  1635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  95.93 
 
 		 810 aa  1634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  96.05 
 
 		 810 aa  1635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  95.93 
 
 		 810 aa  1634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  99.26 
 
 		 810 aa  1677    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  95.8 
 
 		 810 aa  1633    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  92.1 
 
 		 810 aa  1583    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  99.14 
 
 		 810 aa  1675    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  99.01 
 
 		 810 aa  1677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  99.14 
 
 		 810 aa  1676    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  85.8 
 
 		 810 aa  1443    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  99.14 
 
 		 810 aa  1677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  100 
 
 		 810 aa  1688    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  39.09 
 
 		 805 aa  593  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  39.82 
 
 		 807 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  38.96 
 
 		 799 aa  555  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  36.53 
 
 		 796 aa  505  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  35.19 
 
 		 847 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  38.26 
 
 		 765 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  38.14 
 
 		 765 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  38.26 
 
 		 765 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  34.03 
 
 		 846 aa  485  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  38.14 
 
 		 765 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  38.14 
 
 		 765 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  38.26 
 
 		 765 aa  485  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  38.26 
 
 		 765 aa  485  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  38.14 
 
 		 765 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  38.04 
 
 		 765 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  38.04 
 
 		 765 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  37.89 
 
 		 765 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  35.12 
 
 		 847 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  34.07 
 
 		 847 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  35.28 
 
 		 765 aa  458  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  33.96 
 
 		 785 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  31.84 
 
 		 867 aa  428  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  34.49 
 
 		 786 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  31.37 
 
 		 830 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  34.26 
 
 		 786 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  33.21 
 
 		 786 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  32.64 
 
 		 848 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  31.75 
 
 		 831 aa  399  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  32.71 
 
 		 828 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  32.56 
 
 		 811 aa  396  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  31.73 
 
 		 796 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  32.67 
 
 		 848 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  31.35 
 
 		 789 aa  391  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  32.09 
 
 		 825 aa  389  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  32.38 
 
 		 847 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  32.63 
 
 		 808 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  31.62 
 
 		 846 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  32.35 
 
 		 826 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  31.21 
 
 		 808 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  31.87 
 
 		 831 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  31.6 
 
 		 829 aa  376  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  32.25 
 
 		 823 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  31.72 
 
 		 834 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  30.73 
 
 		 828 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  31.69 
 
 		 848 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  32.17 
 
 		 786 aa  363  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  31.59 
 
 		 782 aa  343  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  28.99 
 
 		 811 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  30.34 
 
 		 817 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  35.18 
 
 		 518 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  26.05 
 
 		 987 aa  255  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  26.6 
 
 		 768 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  29.22 
 
 		 739 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  26.45 
 
 		 862 aa  211  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  28.74 
 
 		 752 aa  201  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  26.87 
 
 		 749 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  27.59 
 
 		 742 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  28.3 
 
 		 742 aa  195  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  27.3 
 
 		 749 aa  193  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3208  formate acetyltransferase  28.4 
 
 		 763 aa  190  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491624  hitchhiker  0.00152355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  27.84 
 
 		 749 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  26.84 
 
 		 749 aa  188  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  27 
 
 		 749 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  27.18 
 
 		 749 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1694  formate acetyltransferase  27.44 
 
 		 760 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0125988  hitchhiker  0.00465179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  27 
 
 		 749 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  27 
 
 		 749 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  27.37 
 
 		 756 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2671  formate acetyltransferase  27.44 
 
 		 760 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  26.83 
 
 		 749 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2690  formate acetyltransferase  27.44 
 
 		 760 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.87079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2769  formate acetyltransferase  27.44 
 
 		 760 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.664167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2096  formate acetyltransferase  27.63 
 
 		 751 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1136  formate acetyltransferase  26.85 
 
 		 774 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.678757  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  25.77 
 
 		 748 aa  184  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1086  formate acetyltransferase  27.36 
 
 		 760 aa  184  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1071  formate acetyltransferase  27.36 
 
 		 760 aa  184  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.54519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1006  formate acetyltransferase  27.36 
 
 		 760 aa  184  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0978  formate acetyltransferase  27.36 
 
 		 760 aa  184  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1037  formate acetyltransferase  27.36 
 
 		 760 aa  184  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101477  normal  0.620237 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  26.83 
 
 		 749 aa  184  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  26.83 
 
 		 749 aa  184  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>