211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4398 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  99.22 
 
 		 765 aa  1578    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  100 
 
 		 765 aa  1590    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  99.08 
 
 		 765 aa  1576    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  61.21 
 
 		 765 aa  1004    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  92.42 
 
 		 765 aa  1470    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  99.35 
 
 		 765 aa  1577    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  99.22 
 
 		 765 aa  1578    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  99.22 
 
 		 765 aa  1578    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  99.48 
 
 		 765 aa  1580    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  99.22 
 
 		 765 aa  1577    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  92.42 
 
 		 765 aa  1469    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  99.22 
 
 		 765 aa  1578    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  40.36 
 
 		 799 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  40.17 
 
 		 847 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  37.72 
 
 		 846 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  37.71 
 
 		 847 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  37.25 
 
 		 847 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  36.42 
 
 		 867 aa  535  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  36.43 
 
 		 796 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  35.05 
 
 		 802 aa  498  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  38.22 
 
 		 818 aa  490  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  38.01 
 
 		 810 aa  488  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  37.76 
 
 		 810 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  37.92 
 
 		 807 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  37.76 
 
 		 810 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  37.64 
 
 		 810 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  37.64 
 
 		 810 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  37.14 
 
 		 810 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  37.64 
 
 		 810 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  37.64 
 
 		 810 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  37.52 
 
 		 810 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  37.64 
 
 		 810 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  37.64 
 
 		 810 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  37.39 
 
 		 810 aa  482  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  37.39 
 
 		 810 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  37.39 
 
 		 810 aa  482  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  37.61 
 
 		 810 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  35.98 
 
 		 785 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  34.22 
 
 		 789 aa  459  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  34.35 
 
 		 807 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  33.46 
 
 		 805 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  34.09 
 
 		 848 aa  451  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  34.55 
 
 		 831 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  35.61 
 
 		 786 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  33.63 
 
 		 846 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  34.22 
 
 		 847 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  33.67 
 
 		 834 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  34.34 
 
 		 808 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  34.63 
 
 		 848 aa  435  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  34.3 
 
 		 786 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  32.87 
 
 		 796 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  34.26 
 
 		 786 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  33.96 
 
 		 848 aa  425  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  34.42 
 
 		 808 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  32.71 
 
 		 811 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  33.17 
 
 		 786 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  33.29 
 
 		 828 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  32.88 
 
 		 828 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  31.6 
 
 		 823 aa  389  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  32.47 
 
 		 831 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  33 
 
 		 829 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  31.59 
 
 		 830 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  32.74 
 
 		 782 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  32.28 
 
 		 825 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  32.91 
 
 		 826 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  31.77 
 
 		 817 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  28.89 
 
 		 987 aa  331  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  28.91 
 
 		 811 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  35.4 
 
 		 518 aa  278  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  26.44 
 
 		 768 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  24.69 
 
 		 862 aa  190  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  27.34 
 
 		 752 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  24.66 
 
 		 749 aa  160  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  24.6 
 
 		 749 aa  160  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  24.21 
 
 		 742 aa  159  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  25.21 
 
 		 744 aa  158  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  25.21 
 
 		 744 aa  158  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  25.07 
 
 		 749 aa  159  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  26.4 
 
 		 755 aa  158  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.5 
 
 		 749 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.36 
 
 		 749 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  24.25 
 
 		 749 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  24.89 
 
 		 749 aa  157  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  24.89 
 
 		 749 aa  157  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  24.89 
 
 		 749 aa  157  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  24.89 
 
 		 749 aa  157  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  24.52 
 
 		 749 aa  157  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  24.68 
 
 		 749 aa  157  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  24.96 
 
 		 754 aa  157  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1080  formate acetyltransferase  26.14 
 
 		 759 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  26.1 
 
 		 756 aa  156  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2980  formate acetyltransferase  25.81 
 
 		 758 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.235971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  25.62 
 
 		 743 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1895  formate acetyltransferase  24.96 
 
 		 753 aa  152  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  24.88 
 
 		 760 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2718  formate acetyltransferase  24.11 
 
 		 742 aa  152  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  24.17 
 
 		 749 aa  152  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  24.17 
 
 		 749 aa  152  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3000  formate acetyltransferase  26.58 
 
 		 752 aa  151  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1058  formate acetyltransferase  25.45 
 
 		 745 aa  151  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>