211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0911 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  95.8 
 
 
810 aa  1633    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  95.68 
 
 
810 aa  1632    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  51.35 
 
 
818 aa  839    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  95.8 
 
 
810 aa  1634    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  99.63 
 
 
810 aa  1684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  99.51 
 
 
810 aa  1682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  99.38 
 
 
810 aa  1681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  100 
 
 
810 aa  1689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  91.36 
 
 
810 aa  1577    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  95.8 
 
 
810 aa  1633    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  99.51 
 
 
810 aa  1682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  71.04 
 
 
807 aa  1212    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  95.68 
 
 
810 aa  1630    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  95.8 
 
 
810 aa  1631    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  95.68 
 
 
810 aa  1635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  47.15 
 
 
802 aa  768    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  85.3 
 
 
810 aa  1440    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  95.8 
 
 
810 aa  1633    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  38.45 
 
 
805 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  39.59 
 
 
807 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  38.98 
 
 
799 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  36.9 
 
 
796 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  37.67 
 
 
765 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.299807 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  37.76 
 
 
765 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  37.89 
 
 
765 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  37.55 
 
 
765 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  37.76 
 
 
765 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  37.76 
 
 
765 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  37.89 
 
 
765 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  37.89 
 
 
765 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  37.76 
 
 
765 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  37.89 
 
 
765 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  33.68 
 
 
846 aa  482  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  34.33 
 
 
847 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  37.52 
 
 
765 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  35.08 
 
 
847 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  33.76 
 
 
847 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  34.91 
 
 
765 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  32.38 
 
 
867 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  32.84 
 
 
785 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  33.83 
 
 
786 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  33.08 
 
 
786 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  32.96 
 
 
848 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  32.33 
 
 
828 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  32.1 
 
 
796 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  33.88 
 
 
786 aa  399  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  32.06 
 
 
811 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  32.64 
 
 
848 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  31.47 
 
 
789 aa  392  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  30.75 
 
 
830 aa  392  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  31.37 
 
 
831 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  31.97 
 
 
825 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  31.85 
 
 
846 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  32.63 
 
 
847 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  31.99 
 
 
831 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  32.88 
 
 
808 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  32.27 
 
 
826 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  31.85 
 
 
834 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  31.32 
 
 
808 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  30.99 
 
 
829 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  32.28 
 
 
848 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  31.75 
 
 
823 aa  364  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  29.82 
 
 
828 aa  363  6e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  32.17 
 
 
786 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  29.71 
 
 
811 aa  340  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  31.22 
 
 
782 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  30.7 
 
 
817 aa  327  6e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  34.99 
 
 
518 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  25.43 
 
 
987 aa  255  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  27.12 
 
 
768 aa  231  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  29.46 
 
 
739 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  26.38 
 
 
862 aa  207  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  29.17 
 
 
752 aa  203  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  27.02 
 
 
749 aa  198  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  28.84 
 
 
742 aa  195  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3208  formate acetyltransferase  28.89 
 
 
763 aa  194  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491624  hitchhiker  0.00152355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  26.03 
 
 
749 aa  194  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  27.08 
 
 
742 aa  191  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  26.03 
 
 
749 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  25.88 
 
 
749 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  28.04 
 
 
756 aa  189  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  27.88 
 
 
754 aa  189  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.74 
 
 
749 aa  188  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.74 
 
 
749 aa  188  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  25.74 
 
 
749 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  28.7 
 
 
749 aa  187  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  26.09 
 
 
748 aa  187  7e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  25.6 
 
 
749 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  25.6 
 
 
749 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  25.6 
 
 
749 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  25.46 
 
 
749 aa  184  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  28.45 
 
 
744 aa  183  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  28.45 
 
 
744 aa  183  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  26.84 
 
 
749 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  26.84 
 
 
749 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2096  formate acetyltransferase  27.84 
 
 
751 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440199  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  28.4 
 
 
760 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  27.72 
 
 
756 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2671  formate acetyltransferase  26.72 
 
 
760 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2690  formate acetyltransferase  26.72 
 
 
760 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.87079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>