211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1174 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  52.15 
 
 		 846 aa  926    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  51.03 
 
 		 847 aa  910    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  53.03 
 
 		 847 aa  915    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  51.45 
 
 		 847 aa  905    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  100 
 
 		 867 aa  1809    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  48.75 
 
 		 799 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  41.82 
 
 		 796 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  33.1 
 
 		 810 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  32.46 
 
 		 805 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  31.84 
 
 		 810 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  32.07 
 
 		 810 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  31.84 
 
 		 810 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  31.84 
 
 		 810 aa  428  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  31.84 
 
 		 810 aa  428  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  31.73 
 
 		 810 aa  425  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  32.38 
 
 		 810 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  32.49 
 
 		 810 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  32.49 
 
 		 810 aa  426  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  32.49 
 
 		 810 aa  426  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  32.49 
 
 		 810 aa  426  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  32.15 
 
 		 810 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  31.73 
 
 		 810 aa  426  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  31.49 
 
 		 810 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  37.24 
 
 		 765 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  37.24 
 
 		 765 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  36.55 
 
 		 765 aa  395  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  36.03 
 
 		 765 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  36.21 
 
 		 765 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  35.33 
 
 		 818 aa  395  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  36.38 
 
 		 765 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  36.03 
 
 		 765 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  36.03 
 
 		 765 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  36.03 
 
 		 765 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  36.21 
 
 		 765 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  36.21 
 
 		 765 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  30.62 
 
 		 786 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  33.89 
 
 		 802 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  36.73 
 
 		 848 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  34.97 
 
 		 807 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  37.85 
 
 		 848 aa  366  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  36.39 
 
 		 846 aa  364  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  34.88 
 
 		 765 aa  360  4e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  36.22 
 
 		 834 aa  359  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  34.98 
 
 		 789 aa  357  6.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  35.37 
 
 		 847 aa  354  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  35.54 
 
 		 831 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  35.71 
 
 		 848 aa  351  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  35.86 
 
 		 808 aa  351  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  28.04 
 
 		 817 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  34.86 
 
 		 808 aa  328  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  33.73 
 
 		 807 aa  327  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  33.22 
 
 		 831 aa  325  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  33.39 
 
 		 782 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  34.05 
 
 		 828 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  33.71 
 
 		 825 aa  312  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  32.15 
 
 		 830 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  33.05 
 
 		 796 aa  305  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  32.78 
 
 		 828 aa  301  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  31.48 
 
 		 786 aa  298  4e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  32.16 
 
 		 829 aa  296  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  30.9 
 
 		 785 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  31.71 
 
 		 823 aa  293  7e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  31.08 
 
 		 811 aa  291  5.0000000000000004e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  31.18 
 
 		 786 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  31.89 
 
 		 826 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  31.31 
 
 		 786 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  25.2 
 
 		 987 aa  270  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  31.51 
 
 		 518 aa  260  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  27.07 
 
 		 811 aa  237  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2755  pyruvate-formate lyase  36.84 
 
 		 326 aa  170  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0853745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  24.54 
 
 		 862 aa  156  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  25.76 
 
 		 768 aa  151  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  40.64 
 
 		 749 aa  145  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  39.57 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  39.57 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  39.57 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  39.57 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  39.57 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  39.57 
 
 		 749 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  39.57 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  39.57 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  39.57 
 
 		 749 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  39.04 
 
 		 749 aa  142  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  39.04 
 
 		 749 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  39.25 
 
 		 760 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  38.42 
 
 		 742 aa  140  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  38.74 
 
 		 752 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1546  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1351 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369989 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  38.5 
 
 		 755 aa  137  7.000000000000001e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  39.36 
 
 		 742 aa  135  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  38.22 
 
 		 760 aa  134  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  38.22 
 
 		 756 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3503  formate acetyltransferase  37.7 
 
 		 764 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3432  formate acetyltransferase  37.7 
 
 		 764 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3429  formate acetyltransferase  37.7 
 
 		 764 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  38.3 
 
 		 743 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3599  formate acetyltransferase  37.7 
 
 		 764 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003976  pyruvate formate-lyase  37.7 
 
 		 758 aa  133  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3536  formate acetyltransferase  37.7 
 
 		 764 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0584  formate acetyltransferase  37.7 
 
 		 764 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.80085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>