211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2499 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  61.17 
 
 		 786 aa  1015    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  78.27 
 
 		 786 aa  1263    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  57.89 
 
 		 786 aa  976    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  59.18 
 
 		 796 aa  989    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  51.08 
 
 		 811 aa  851    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  64.76 
 
 		 785 aa  1092    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  100 
 
 		 786 aa  1629    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  38.45 
 
 		 799 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  35.02 
 
 		 847 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  34.85 
 
 		 796 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  33.33 
 
 		 846 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  34.67 
 
 		 765 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  33.54 
 
 		 802 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  34.67 
 
 		 765 aa  435  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  33.73 
 
 		 847 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  34.67 
 
 		 765 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  34.43 
 
 		 765 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  34.67 
 
 		 765 aa  435  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  34.67 
 
 		 765 aa  435  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  34.55 
 
 		 765 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  34.43 
 
 		 765 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  34.55 
 
 		 765 aa  432  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  33.96 
 
 		 818 aa  427  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  33.04 
 
 		 828 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  34.33 
 
 		 765 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  34.33 
 
 		 765 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  32.75 
 
 		 823 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  32.2 
 
 		 789 aa  411  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  33.75 
 
 		 831 aa  412  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  32.32 
 
 		 765 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  32.17 
 
 		 825 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  33.91 
 
 		 848 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  31.81 
 
 		 830 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  32.95 
 
 		 829 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  32.45 
 
 		 848 aa  395  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  33.04 
 
 		 846 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  32.7 
 
 		 828 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  32.54 
 
 		 847 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  30.08 
 
 		 805 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  32.59 
 
 		 782 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  31.71 
 
 		 826 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  32.83 
 
 		 831 aa  382  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  33.63 
 
 		 807 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  32.91 
 
 		 808 aa  376  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  32.03 
 
 		 808 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  30.19 
 
 		 807 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  32.96 
 
 		 848 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  31.11 
 
 		 847 aa  369  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  32.29 
 
 		 810 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  32.42 
 
 		 810 aa  366  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  32.29 
 
 		 810 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  32.32 
 
 		 817 aa  365  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  32.29 
 
 		 810 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  32.29 
 
 		 810 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  32.29 
 
 		 810 aa  364  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  32.17 
 
 		 810 aa  363  8e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  32.17 
 
 		 810 aa  363  9e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  32.17 
 
 		 810 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  32.5 
 
 		 810 aa  361  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  31.79 
 
 		 810 aa  361  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  32.38 
 
 		 810 aa  360  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  32.38 
 
 		 810 aa  360  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  31.83 
 
 		 834 aa  359  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  31 
 
 		 810 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  32.06 
 
 		 810 aa  358  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  30.34 
 
 		 811 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  33.46 
 
 		 518 aa  297  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  28.73 
 
 		 987 aa  294  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  31.18 
 
 		 867 aa  289  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  27.54 
 
 		 862 aa  259  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  26.21 
 
 		 768 aa  211  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  27.62 
 
 		 742 aa  170  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  26.84 
 
 		 749 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  26.84 
 
 		 749 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  27.26 
 
 		 742 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  25.44 
 
 		 749 aa  161  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  27.7 
 
 		 739 aa  161  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1895  formate acetyltransferase  28.3 
 
 		 753 aa  161  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  26.33 
 
 		 749 aa  159  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  26.49 
 
 		 749 aa  158  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  26.49 
 
 		 749 aa  158  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  26.49 
 
 		 749 aa  158  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2224  formate acetyltransferase  25.91 
 
 		 742 aa  158  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000796506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  26.49 
 
 		 749 aa  157  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  26.49 
 
 		 749 aa  157  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  26.49 
 
 		 749 aa  157  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  26.49 
 
 		 749 aa  157  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  27.26 
 
 		 749 aa  157  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  26.92 
 
 		 742 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  24.43 
 
 		 744 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  24.43 
 
 		 744 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  26.62 
 
 		 749 aa  151  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  26.62 
 
 		 749 aa  151  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  25.79 
 
 		 756 aa  151  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  25.14 
 
 		 754 aa  151  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  25.7 
 
 		 752 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36056  predicted protein  27.04 
 
 		 738 aa  149  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  24.46 
 
 		 748 aa  145  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01546  pyruvate-formate lyase  28.52 
 
 		 758 aa  144  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  26.62 
 
 		 755 aa  144  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>