211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3259 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  62.66 
 
 
807 aa  1051    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  42.71 
 
 
802 aa  686    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  100 
 
 
805 aa  1675    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  39.09 
 
 
810 aa  595  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  39.21 
 
 
810 aa  595  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  37.95 
 
 
818 aa  594  1e-168  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  39.09 
 
 
810 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  39.09 
 
 
810 aa  595  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  38.96 
 
 
810 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  39.09 
 
 
810 aa  595  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  38.96 
 
 
810 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  39.09 
 
 
810 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  38 
 
 
807 aa  591  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  38.71 
 
 
810 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  38.71 
 
 
810 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  38.71 
 
 
810 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  38.71 
 
 
810 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  38.45 
 
 
810 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  38.25 
 
 
810 aa  582  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  38.12 
 
 
810 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  37.36 
 
 
799 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  34.69 
 
 
847 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  34.98 
 
 
846 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  35.28 
 
 
796 aa  485  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  34.15 
 
 
847 aa  479  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  34.94 
 
 
828 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  32.46 
 
 
867 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  33.46 
 
 
765 aa  450  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  33.21 
 
 
765 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  33.33 
 
 
765 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  33.21 
 
 
765 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  34.77 
 
 
825 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  33.46 
 
 
765 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  33.21 
 
 
765 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  33.21 
 
 
765 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  33.33 
 
 
765 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  33.08 
 
 
765 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  34.13 
 
 
765 aa  442  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  32.91 
 
 
765 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  32.91 
 
 
765 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  32.56 
 
 
831 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  34.45 
 
 
848 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  31.82 
 
 
789 aa  428  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  32.84 
 
 
829 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  33.04 
 
 
786 aa  420  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  32.62 
 
 
785 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  31.86 
 
 
830 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  31.73 
 
 
823 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  32.56 
 
 
828 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  32.8 
 
 
808 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  32.96 
 
 
808 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  33.33 
 
 
846 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  32.71 
 
 
847 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  31.41 
 
 
796 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  32.34 
 
 
848 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  30.51 
 
 
826 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  31.91 
 
 
811 aa  390  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  31.98 
 
 
847 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  30.04 
 
 
786 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  31.04 
 
 
786 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  33 
 
 
848 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  30.08 
 
 
786 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  30.6 
 
 
831 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  31.34 
 
 
834 aa  381  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  29.29 
 
 
782 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  29.69 
 
 
811 aa  325  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  27.78 
 
 
817 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  36.12 
 
 
518 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  27.92 
 
 
862 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  24.91 
 
 
987 aa  251  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  26.41 
 
 
768 aa  232  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  26.15 
 
 
749 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  26.22 
 
 
749 aa  192  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  26.22 
 
 
749 aa  192  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  24.89 
 
 
742 aa  190  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  26.83 
 
 
749 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  25.37 
 
 
739 aa  189  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  25.14 
 
 
756 aa  188  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  25.78 
 
 
748 aa  184  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  25.98 
 
 
749 aa  178  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  25.22 
 
 
752 aa  177  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  25.83 
 
 
749 aa  177  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1058  formate acetyltransferase  24.73 
 
 
745 aa  177  8e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  25.54 
 
 
749 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02963  pyruvate-formate lyase  25.88 
 
 
765 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  25.54 
 
 
749 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.54 
 
 
749 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  25.54 
 
 
749 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  25.54 
 
 
749 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  25.54 
 
 
749 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  25.54 
 
 
749 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.54 
 
 
749 aa  173  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  24.34 
 
 
756 aa  173  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1136  formate acetyltransferase  24.35 
 
 
774 aa  171  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.678757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  25.37 
 
 
742 aa  171  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  25.64 
 
 
755 aa  171  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2718  formate acetyltransferase  24.49 
 
 
742 aa  171  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  25.68 
 
 
760 aa  170  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0584  formate acetyltransferase  25.99 
 
 
764 aa  170  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.80085  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1729  formate acetyltransferase  25.95 
 
 
760 aa  169  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>