180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1357 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  66.42 
 
 
808 aa  1155    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  57.38 
 
 
808 aa  966    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  82.55 
 
 
846 aa  1499    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  64.59 
 
 
831 aa  1112    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  64.82 
 
 
847 aa  1186    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  63.84 
 
 
834 aa  1096    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  100 
 
 
848 aa  1775    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  77.95 
 
 
848 aa  1443    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  63.89 
 
 
848 aa  1157    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  37.01 
 
 
799 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  35.14 
 
 
847 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  34.61 
 
 
802 aa  450  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  34.92 
 
 
785 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  34.51 
 
 
765 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  34.24 
 
 
846 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  34.59 
 
 
847 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  34.51 
 
 
765 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  34.51 
 
 
765 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  33.92 
 
 
825 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  34.51 
 
 
765 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  34.63 
 
 
765 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.514532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  34.51 
 
 
765 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  34.34 
 
 
765 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  34.34 
 
 
765 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  33.96 
 
 
828 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  34.38 
 
 
765 aa  439  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  32.95 
 
 
830 aa  435  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  34.43 
 
 
823 aa  436  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  34.05 
 
 
847 aa  435  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  33.29 
 
 
829 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  33.17 
 
 
765 aa  430  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  34.38 
 
 
828 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  34.43 
 
 
765 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  33.13 
 
 
818 aa  426  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  34.3 
 
 
765 aa  429  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  32.54 
 
 
831 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  34.5 
 
 
786 aa  422  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  34.12 
 
 
786 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  32.17 
 
 
826 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  34.63 
 
 
796 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  33 
 
 
805 aa  405  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  34.01 
 
 
807 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  33.63 
 
 
786 aa  399  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  32.41 
 
 
789 aa  398  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  31.8 
 
 
811 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  32.06 
 
 
807 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  32.96 
 
 
786 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  32.16 
 
 
810 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  32.28 
 
 
810 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  32.16 
 
 
810 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  32.28 
 
 
810 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  32.28 
 
 
810 aa  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  31.86 
 
 
796 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  32.28 
 
 
810 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  31.69 
 
 
810 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  31.69 
 
 
810 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  31.94 
 
 
810 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  31.82 
 
 
810 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  31.57 
 
 
810 aa  376  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  31.57 
 
 
810 aa  376  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  32.19 
 
 
810 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  31.31 
 
 
810 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  31.31 
 
 
810 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  37.85 
 
 
867 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  30.71 
 
 
817 aa  350  8e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  29.94 
 
 
811 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  28.63 
 
 
782 aa  336  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  36.58 
 
 
518 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  26.86 
 
 
987 aa  302  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  27.62 
 
 
862 aa  258  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  26.62 
 
 
768 aa  232  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  25.23 
 
 
739 aa  152  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  23.84 
 
 
752 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  24.03 
 
 
742 aa  144  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  24.91 
 
 
755 aa  144  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  25.88 
 
 
743 aa  144  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  23.05 
 
 
749 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  24.21 
 
 
749 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  24.35 
 
 
748 aa  143  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  24.13 
 
 
742 aa  142  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  24.73 
 
 
742 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1895  formate acetyltransferase  24.8 
 
 
753 aa  141  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349788  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  24.77 
 
 
749 aa  140  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  24.77 
 
 
749 aa  140  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  24 
 
 
754 aa  139  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003976  pyruvate formate-lyase  25.32 
 
 
758 aa  138  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  23.48 
 
 
760 aa  136  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  23.21 
 
 
756 aa  135  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2718  formate acetyltransferase  24.68 
 
 
742 aa  135  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1058  formate acetyltransferase  24.04 
 
 
745 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1136  formate acetyltransferase  23.39 
 
 
774 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.678757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2425  formate acetyltransferase  24.64 
 
 
760 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2755  pyruvate-formate lyase  30.51 
 
 
326 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0853745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1064  formate acetyltransferase  24.59 
 
 
760 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95333  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2218  formate acetyltransferase  24.59 
 
 
760 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.673985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00907  pyruvate formate lyase I  24.46 
 
 
760 aa  132  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2740  formate acetyltransferase  24.46 
 
 
760 aa  132  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2096  formate acetyltransferase  24.17 
 
 
751 aa  132  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440199  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1457  formate acetyltransferase  24.45 
 
 
787 aa  132  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1702  formate acetyltransferase  24.72 
 
 
760 aa  132  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.548402 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>