209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1064 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0656  formate acetyltransferase  62.06 
 
 
718 aa  903    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0887776  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00907  pyruvate formate lyase I  99.47 
 
 
760 aa  1582    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593107  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  63.16 
 
 
755 aa  989    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02981  pyruvate formate-lyase 4/2-ketobutyrate formate-lyase  79.26 
 
 
764 aa  1292    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  65.13 
 
 
749 aa  1053    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0589  formate acetyltransferase  79.26 
 
 
764 aa  1292    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2425  formate acetyltransferase  99.61 
 
 
760 aa  1582    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2740  formate acetyltransferase  99.47 
 
 
760 aa  1582    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1997  formate acetyltransferase  90.92 
 
 
760 aa  1471    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4427  formate acetyltransferase  79.12 
 
 
764 aa  1290    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.017664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0978  formate acetyltransferase  95.92 
 
 
760 aa  1538    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  66.53 
 
 
748 aa  1064    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  64.87 
 
 
749 aa  1049    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003976  pyruvate formate-lyase  83.11 
 
 
758 aa  1348    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  63.02 
 
 
756 aa  981    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2912  formate acetyltransferase  81.18 
 
 
760 aa  1330    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  65.26 
 
 
749 aa  1055    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  65 
 
 
749 aa  1051    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  65 
 
 
749 aa  1051    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2096  formate acetyltransferase  64.85 
 
 
751 aa  1014    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440199  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3432  formate acetyltransferase  78.86 
 
 
764 aa  1281    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3208  formate acetyltransferase  61.47 
 
 
763 aa  959    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491624  hitchhiker  0.00152355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  65.39 
 
 
749 aa  1055    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2345  formate acetyltransferase  91.84 
 
 
760 aa  1485    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2243  formate acetyltransferase  91.84 
 
 
760 aa  1484    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3503  formate acetyltransferase  78.99 
 
 
764 aa  1284    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  64.53 
 
 
742 aa  1021    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  65.26 
 
 
749 aa  1055    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3429  formate acetyltransferase  78.99 
 
 
764 aa  1283    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3000  formate acetyltransferase  64.27 
 
 
752 aa  1008    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1080  formate acetyltransferase  64.88 
 
 
759 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  63.35 
 
 
754 aa  981    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2980  formate acetyltransferase  64.88 
 
 
758 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.235971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2406  formate acetyltransferase  78.29 
 
 
760 aa  1282    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  59.84 
 
 
756 aa  921    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  60.67 
 
 
744 aa  944    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  60.53 
 
 
744 aa  941    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0693  pyruvate-formate lyase  54.11 
 
 
791 aa  824    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.195735  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1136  formate acetyltransferase  81.65 
 
 
774 aa  1347    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.678757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1494  formate acetyltransferase  81.97 
 
 
760 aa  1343    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266932  normal  0.345875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1561  formate acetyltransferase  81.84 
 
 
760 aa  1341    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.404679  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2473  formate acetyltransferase  79.47 
 
 
760 aa  1305    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.544936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  57.64 
 
 
742 aa  894    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1058  formate acetyltransferase  64.9 
 
 
745 aa  1017    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2718  formate acetyltransferase  63.32 
 
 
742 aa  981    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1555  formate acetyltransferase  81.58 
 
 
760 aa  1338    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.306811 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1498  formate C-acetyltransferase  80.13 
 
 
760 aa  1308    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0584  formate acetyltransferase  79.26 
 
 
764 aa  1291    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.80085  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3307  formate acetyltransferase  79.5 
 
 
761 aa  1302    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220924  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3599  formate acetyltransferase  78.99 
 
 
764 aa  1283    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37826  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2218  formate acetyltransferase  100 
 
 
760 aa  1588    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  65.01 
 
 
742 aa  1034    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2671  formate acetyltransferase  81.58 
 
 
760 aa  1336    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2390  formate acetyltransferase  80.79 
 
 
760 aa  1322    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0262842  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  58.61 
 
 
743 aa  897    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1006  formate acetyltransferase  95.92 
 
 
760 aa  1538    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3243  formate acetyltransferase  79.12 
 
 
764 aa  1291    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1694  formate acetyltransferase  81.58 
 
 
760 aa  1336    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0125988  hitchhiker  0.00465179 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  59.92 
 
 
739 aa  943    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36056  predicted protein  51.01 
 
 
738 aa  745    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2224  formate acetyltransferase  53.08 
 
 
742 aa  824    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000796506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1423  formate acetyltransferase  93.95 
 
 
760 aa  1514    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1955  formate acetyltransferase 1  79.95 
 
 
758 aa  1305    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  76.53 
 
 
760 aa  1247    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1086  formate acetyltransferase  95.79 
 
 
760 aa  1538    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2378  formate acetyltransferase  80.66 
 
 
760 aa  1329    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.499739  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1457  formate acetyltransferase  82.45 
 
 
787 aa  1343    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1729  formate acetyltransferase  91.84 
 
 
760 aa  1481    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  65.92 
 
 
749 aa  1068    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  65.92 
 
 
749 aa  1068    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2690  formate acetyltransferase  81.58 
 
 
760 aa  1336    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.87079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  65.66 
 
 
749 aa  1058    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00914  hypothetical protein  99.47 
 
 
760 aa  1582    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2589  formate acetyltransferase  90.13 
 
 
760 aa  1453    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2693  formate acetyltransferase  99.47 
 
 
760 aa  1582    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.456571 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01546  pyruvate-formate lyase  81.66 
 
 
758 aa  1319    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02963  pyruvate-formate lyase  75.63 
 
 
765 aa  1238    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02932  hypothetical protein  79.26 
 
 
764 aa  1292    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1009  formate acetyltransferase  99.47 
 
 
760 aa  1582    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0227334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  65.66 
 
 
749 aa  1060    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3302  formate acetyltransferase  79.26 
 
 
764 aa  1292    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.674178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1064  formate acetyltransferase  100 
 
 
760 aa  1588    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95333  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  63.14 
 
 
752 aa  978    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1000  formate acetyltransferase  99.47 
 
 
760 aa  1582    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.623819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2883  formate acetyltransferase  79.87 
 
 
760 aa  1308    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0131887  hitchhiker  0.00000877037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3588  formate acetyltransferase  79.26 
 
 
764 aa  1291    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  64.91 
 
 
760 aa  1053    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1708  formate C-acetyltransferase  80 
 
 
760 aa  1302    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0108007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1702  formate acetyltransferase  89.47 
 
 
760 aa  1449    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.548402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  65.26 
 
 
749 aa  1055    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3410  formate acetyltransferase  79.39 
 
 
764 aa  1294    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1672  formate acetyltransferase  80.92 
 
 
760 aa  1329    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  67.55 
 
 
749 aa  1068    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1071  formate acetyltransferase  95.92 
 
 
760 aa  1538    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.54519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2769  formate acetyltransferase  81.58 
 
 
760 aa  1336    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.664167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3536  formate acetyltransferase  78.99 
 
 
764 aa  1283    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1037  formate acetyltransferase  95.92 
 
 
760 aa  1538    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101477  normal  0.620237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2677  formate acetyltransferase  90.13 
 
 
760 aa  1453    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2823  formate acetyltransferase  65.12 
 
 
686 aa  915    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.975039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1946  formate acetyltransferase 1  90.13 
 
 
760 aa  1453    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218638  normal  0.0948953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>