211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2406 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0656  formate acetyltransferase  63.62 
 
 		 718 aa  895    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0887776  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00907  pyruvate formate lyase I  78.68 
 
 		 760 aa  1287    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02932  hypothetical protein  73.61 
 
 		 764 aa  1219    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02981  pyruvate formate-lyase 4/2-ketobutyrate formate-lyase  73.61 
 
 		 764 aa  1219    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3599  formate acetyltransferase  72.81 
 
 		 764 aa  1206    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37826  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0589  formate acetyltransferase  73.61 
 
 		 764 aa  1219    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2883  formate acetyltransferase  85.13 
 
 		 760 aa  1392    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0131887  hitchhiker  0.00000877037 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2740  formate acetyltransferase  78.68 
 
 		 760 aa  1287    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1997  formate acetyltransferase  78.03 
 
 		 760 aa  1282    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1955  formate acetyltransferase 1  79.97 
 
 		 758 aa  1288    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  64.67 
 
 		 749 aa  1040    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  63.36 
 
 		 748 aa  1035    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  64.67 
 
 		 749 aa  1041    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  60.8 
 
 		 752 aa  956    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  61.65 
 
 		 756 aa  968    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2912  formate acetyltransferase  87.11 
 
 		 760 aa  1410    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  64.53 
 
 		 749 aa  1038    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  64.53 
 
 		 749 aa  1038    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  64.53 
 
 		 749 aa  1038    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2096  formate acetyltransferase  63.91 
 
 		 751 aa  1007    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3432  formate acetyltransferase  72.81 
 
 		 764 aa  1207    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003976  pyruvate formate-lyase  79.05 
 
 		 758 aa  1286    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  65.07 
 
 		 749 aa  1048    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3243  formate acetyltransferase  73.47 
 
 		 764 aa  1219    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4427  formate acetyltransferase  73.47 
 
 		 764 aa  1217    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.017664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1071  formate acetyltransferase  78.82 
 
 		 760 aa  1281    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.54519 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  60.77 
 
 		 754 aa  944    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  64.53 
 
 		 749 aa  1038    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2345  formate acetyltransferase  77.76 
 
 		 760 aa  1277    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3000  formate acetyltransferase  62.72 
 
 		 752 aa  985    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1080  formate acetyltransferase  62.95 
 
 		 759 aa  993    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00914  hypothetical protein  78.68 
 
 		 760 aa  1287    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2980  formate acetyltransferase  63.22 
 
 		 758 aa  998    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.235971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2406  formate acetyltransferase  100 
 
 		 760 aa  1590    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  58.96 
 
 		 756 aa  908    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1946  formate acetyltransferase 1  77.11 
 
 		 760 aa  1273    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218638  normal  0.0948953 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  60.26 
 
 		 744 aa  943    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3429  formate acetyltransferase  72.94 
 
 		 764 aa  1209    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  60.26 
 
 		 744 aa  943    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3410  formate acetyltransferase  73.74 
 
 		 764 aa  1222    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1136  formate acetyltransferase  75.19 
 
 		 774 aa  1244    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.678757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1494  formate acetyltransferase  87.5 
 
 		 760 aa  1414    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266932  normal  0.345875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1561  formate acetyltransferase  87.37 
 
 		 760 aa  1413    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.404679  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2473  formate acetyltransferase  87.63 
 
 		 760 aa  1429    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.544936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  55.36 
 
 		 742 aa  862    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1058  formate acetyltransferase  62.5 
 
 		 745 aa  980    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2718  formate acetyltransferase  62.2 
 
 		 742 aa  968    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1555  formate acetyltransferase  87.37 
 
 		 760 aa  1414    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.306811 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1498  formate C-acetyltransferase  85.66 
 
 		 760 aa  1395    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1694  formate acetyltransferase  86.71 
 
 		 760 aa  1401    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0125988  hitchhiker  0.00465179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3307  formate acetyltransferase  77.53 
 
 		 761 aa  1255    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0693  pyruvate-formate lyase  51.41 
 
 		 791 aa  801    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.195735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2218  formate acetyltransferase  78.29 
 
 		 760 aa  1282    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  63.27 
 
 		 742 aa  1018    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2671  formate acetyltransferase  86.71 
 
 		 760 aa  1401    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2390  formate acetyltransferase  85.79 
 
 		 760 aa  1399    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0262842  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  56.63 
 
 		 743 aa  872    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  63.02 
 
 		 742 aa  1008    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2677  formate acetyltransferase  77.11 
 
 		 760 aa  1273    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1064  formate acetyltransferase  78.29 
 
 		 760 aa  1282    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0584  formate acetyltransferase  73.61 
 
 		 764 aa  1219    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.80085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36056  predicted protein  52.14 
 
 		 738 aa  744    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2224  formate acetyltransferase  53.08 
 
 		 742 aa  818    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000796506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1423  formate acetyltransferase  78.42 
 
 		 760 aa  1274    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  59.38 
 
 		 739 aa  947    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  71.45 
 
 		 760 aa  1188    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3503  formate acetyltransferase  72.81 
 
 		 764 aa  1207    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2378  formate acetyltransferase  86.58 
 
 		 760 aa  1405    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.499739  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1457  formate acetyltransferase  80.5 
 
 		 787 aa  1317    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1006  formate acetyltransferase  78.82 
 
 		 760 aa  1281    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  63.29 
 
 		 749 aa  1038    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  63.29 
 
 		 749 aa  1038    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2690  formate acetyltransferase  86.71 
 
 		 760 aa  1401    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.87079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  64.21 
 
 		 749 aa  1045    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3208  formate acetyltransferase  59.95 
 
 		 763 aa  946    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491624  hitchhiker  0.00152355 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2589  formate acetyltransferase  77.11 
 
 		 760 aa  1273    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  65.39 
 
 		 749 aa  1055    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01546  pyruvate-formate lyase  79.97 
 
 		 758 aa  1294    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02963  pyruvate-formate lyase  72.03 
 
 		 765 aa  1202    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2243  formate acetyltransferase  78.16 
 
 		 760 aa  1278    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1009  formate acetyltransferase  78.68 
 
 		 760 aa  1287    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0227334  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2425  formate acetyltransferase  78.55 
 
 		 760 aa  1286    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3302  formate acetyltransferase  73.61 
 
 		 764 aa  1219    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.674178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1037  formate acetyltransferase  78.82 
 
 		 760 aa  1281    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101477  normal  0.620237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1729  formate acetyltransferase  77.89 
 
 		 760 aa  1282    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1000  formate acetyltransferase  78.68 
 
 		 760 aa  1287    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.623819  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  60.9 
 
 		 755 aa  988    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3588  formate acetyltransferase  73.61 
 
 		 764 aa  1219    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  64.27 
 
 		 749 aa  1038    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1708  formate C-acetyltransferase  85.53 
 
 		 760 aa  1389    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1702  formate acetyltransferase  77.24 
 
 		 760 aa  1271    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.548402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  64.53 
 
 		 749 aa  1038    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  64.27 
 
 		 749 aa  1035    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1672  formate acetyltransferase  84.87 
 
 		 760 aa  1392    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114365  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0978  formate acetyltransferase  78.82 
 
 		 760 aa  1281    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3536  formate acetyltransferase  72.81 
 
 		 764 aa  1206    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2769  formate acetyltransferase  86.71 
 
 		 760 aa  1401    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.664167 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1086  formate acetyltransferase  78.68 
 
 		 760 aa  1280    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  63.78 
 
 		 760 aa  1023    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2693  formate acetyltransferase  78.68 
 
 		 760 aa  1287    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>