211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2642 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  85.31 
 
 		 810 aa  1457    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  85.19 
 
 		 810 aa  1456    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  51.06 
 
 		 818 aa  831    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  84.81 
 
 		 810 aa  1452    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  68.94 
 
 		 807 aa  1179    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  46.6 
 
 		 802 aa  757    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  85.31 
 
 		 810 aa  1457    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  84.69 
 
 		 810 aa  1451    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  84.81 
 
 		 810 aa  1452    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  83.33 
 
 		 810 aa  1424    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  84.81 
 
 		 810 aa  1453    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  84.69 
 
 		 810 aa  1452    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  85.19 
 
 		 810 aa  1456    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  85.31 
 
 		 810 aa  1459    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  85.31 
 
 		 810 aa  1458    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  100 
 
 		 810 aa  1679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  85.43 
 
 		 810 aa  1460    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  85.31 
 
 		 810 aa  1457    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  39.72 
 
 		 807 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  38.12 
 
 		 805 aa  580  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  38.78 
 
 		 799 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  35.68 
 
 		 796 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  35.67 
 
 		 765 aa  475  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  37.34 
 
 		 765 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  37.34 
 
 		 765 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  37.34 
 
 		 765 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  37.22 
 
 		 765 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  37.1 
 
 		 765 aa  467  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  33.87 
 
 		 847 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  37.22 
 
 		 765 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  37.18 
 
 		 765 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  37.22 
 
 		 765 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  34.64 
 
 		 847 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  37.22 
 
 		 765 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  37.18 
 
 		 765 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  33.45 
 
 		 846 aa  465  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  36.97 
 
 		 765 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  33.1 
 
 		 867 aa  459  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  33.99 
 
 		 847 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  33.42 
 
 		 785 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  34.18 
 
 		 786 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  33.46 
 
 		 786 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  31.82 
 
 		 811 aa  390  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  32.43 
 
 		 796 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  32.5 
 
 		 848 aa  389  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  31.17 
 
 		 789 aa  385  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  33.25 
 
 		 786 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  32.61 
 
 		 848 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  31.94 
 
 		 825 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  32.22 
 
 		 828 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  32.35 
 
 		 847 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  32.2 
 
 		 834 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  31.3 
 
 		 846 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  30 
 
 		 830 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  32.11 
 
 		 831 aa  369  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  31.1 
 
 		 808 aa  365  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  32.19 
 
 		 848 aa  365  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  30.43 
 
 		 831 aa  360  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  32.06 
 
 		 786 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  30.4 
 
 		 829 aa  357  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  31.84 
 
 		 808 aa  357  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  31.3 
 
 		 826 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  32.03 
 
 		 782 aa  343  9e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  29.25 
 
 		 828 aa  341  4e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  31.55 
 
 		 823 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  28.97 
 
 		 811 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  30.65 
 
 		 817 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  34.65 
 
 		 518 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  25.68 
 
 		 987 aa  248  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  27.25 
 
 		 768 aa  234  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  26.96 
 
 		 862 aa  204  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  28.25 
 
 		 739 aa  203  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  28.25 
 
 		 752 aa  188  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  26.59 
 
 		 749 aa  187  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  28 
 
 		 742 aa  185  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  27.04 
 
 		 742 aa  183  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  26.69 
 
 		 756 aa  179  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  27.14 
 
 		 742 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  27.18 
 
 		 749 aa  174  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  26.54 
 
 		 754 aa  174  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2096  formate acetyltransferase  26.79 
 
 		 751 aa  173  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  26.45 
 
 		 749 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3208  formate acetyltransferase  26.96 
 
 		 763 aa  171  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491624  hitchhiker  0.00152355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  24.89 
 
 		 749 aa  170  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  25.2 
 
 		 748 aa  170  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  24.88 
 
 		 749 aa  169  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  24.88 
 
 		 749 aa  169  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3243  formate acetyltransferase  27.16 
 
 		 764 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  24.61 
 
 		 749 aa  168  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02981  pyruvate formate-lyase 4/2-ketobutyrate formate-lyase  26.99 
 
 		 764 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0589  formate acetyltransferase  26.99 
 
 		 764 aa  167  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1058  formate acetyltransferase  23.67 
 
 		 745 aa  168  5e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02932  hypothetical protein  26.99 
 
 		 764 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  27.01 
 
 		 756 aa  167  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0584  formate acetyltransferase  26.99 
 
 		 764 aa  167  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.80085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3302  formate acetyltransferase  26.99 
 
 		 764 aa  167  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.674178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  24.61 
 
 		 749 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3588  formate acetyltransferase  26.99 
 
 		 764 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3410  formate acetyltransferase  26.55 
 
 		 764 aa  167  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  24.61 
 
 		 749 aa  167  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>