207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0979 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  100 
 
 		 817 aa  1712    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  34.74 
 
 		 799 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  33.17 
 
 		 785 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  33.92 
 
 		 786 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  31.62 
 
 		 789 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  33.7 
 
 		 796 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  32 
 
 		 786 aa  372  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  32.98 
 
 		 811 aa  371  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  31.99 
 
 		 811 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  32.32 
 
 		 786 aa  365  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  31.99 
 
 		 828 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  29.91 
 
 		 796 aa  365  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  30.94 
 
 		 802 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  31.92 
 
 		 786 aa  356  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  31.18 
 
 		 848 aa  356  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  30.42 
 
 		 818 aa  353  5.9999999999999994e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  30.77 
 
 		 829 aa  353  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  29.84 
 
 		 825 aa  353  8.999999999999999e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  31.76 
 
 		 765 aa  351  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  30.94 
 
 		 847 aa  350  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  31.77 
 
 		 765 aa  350  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  31.64 
 
 		 765 aa  350  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  31.52 
 
 		 765 aa  349  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  30.84 
 
 		 846 aa  349  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  31.52 
 
 		 765 aa  349  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  31.52 
 
 		 765 aa  349  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  31.52 
 
 		 765 aa  349  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  31.65 
 
 		 765 aa  348  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  31.65 
 
 		 765 aa  347  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  31 
 
 		 848 aa  344  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  30.36 
 
 		 823 aa  344  5e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  29.95 
 
 		 831 aa  340  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  30.15 
 
 		 848 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  30.12 
 
 		 834 aa  336  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  31.48 
 
 		 765 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  31.48 
 
 		 765 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  30.15 
 
 		 831 aa  334  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  28.04 
 
 		 867 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  29.51 
 
 		 847 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  30.65 
 
 		 810 aa  329  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  30.87 
 
 		 808 aa  329  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  29.86 
 
 		 846 aa  328  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  30.7 
 
 		 810 aa  327  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  29.06 
 
 		 847 aa  327  7e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  29.81 
 
 		 830 aa  326  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  30.58 
 
 		 810 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  30.58 
 
 		 810 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  30 
 
 		 828 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  30.58 
 
 		 810 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  30.28 
 
 		 810 aa  325  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  30.35 
 
 		 810 aa  324  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  30.34 
 
 		 810 aa  323  6e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  30.34 
 
 		 810 aa  323  7e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  30.46 
 
 		 810 aa  323  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  30.34 
 
 		 810 aa  323  7e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  30.15 
 
 		 810 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  30.34 
 
 		 810 aa  323  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  30.1 
 
 		 810 aa  321  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  29.45 
 
 		 810 aa  320  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  29.02 
 
 		 847 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  28.25 
 
 		 807 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  27.78 
 
 		 805 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  27.62 
 
 		 808 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  29.41 
 
 		 782 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  29.91 
 
 		 826 aa  303  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  28.5 
 
 		 765 aa  300  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  29.17 
 
 		 807 aa  297  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  29.02 
 
 		 987 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  30.48 
 
 		 862 aa  278  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  32.89 
 
 		 518 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  27.72 
 
 		 768 aa  204  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  25.18 
 
 		 748 aa  115  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2755  pyruvate-formate lyase  30.51 
 
 		 326 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0853745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  25.3 
 
 		 752 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  24.36 
 
 		 742 aa  109  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  24.31 
 
 		 749 aa  107  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  24.31 
 
 		 749 aa  107  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1702  formate acetyltransferase  24.1 
 
 		 760 aa  107  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.548402 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  24.09 
 
 		 749 aa  106  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3536  formate acetyltransferase  24.51 
 
 		 764 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3599  formate acetyltransferase  24.51 
 
 		 764 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2589  formate acetyltransferase  24.11 
 
 		 760 aa  106  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830316  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2677  formate acetyltransferase  24.11 
 
 		 760 aa  106  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1946  formate acetyltransferase 1  24.11 
 
 		 760 aa  106  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218638  normal  0.0948953 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  23.84 
 
 		 742 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3503  formate acetyltransferase  24.51 
 
 		 764 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3432  formate acetyltransferase  24.51 
 
 		 764 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  25.84 
 
 		 755 aa  105  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  23.73 
 
 		 742 aa  105  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2218  formate acetyltransferase  24.07 
 
 		 760 aa  104  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1064  formate acetyltransferase  24.07 
 
 		 760 aa  104  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3588  formate acetyltransferase  24.37 
 
 		 764 aa  104  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2425  formate acetyltransferase  24.07 
 
 		 760 aa  104  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00907  pyruvate formate lyase I  23.76 
 
 		 760 aa  104  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2693  formate acetyltransferase  23.76 
 
 		 760 aa  104  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456571 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2740  formate acetyltransferase  23.76 
 
 		 760 aa  104  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00914  hypothetical protein  23.76 
 
 		 760 aa  104  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1009  formate acetyltransferase  23.76 
 
 		 760 aa  104  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0227334  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1000  formate acetyltransferase  23.76 
 
 		 760 aa  104  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.623819  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3429  formate acetyltransferase  24.36 
 
 		 764 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>