211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4445 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  92.81 
 
 		 765 aa  1457    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  92.42 
 
 		 765 aa  1453    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  100 
 
 		 765 aa  1584    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  99.87 
 
 		 765 aa  1581    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  92.55 
 
 		 765 aa  1454    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  92.42 
 
 		 765 aa  1452    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  92.81 
 
 		 765 aa  1457    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  92.42 
 
 		 765 aa  1454    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  92.81 
 
 		 765 aa  1457    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  92.81 
 
 		 765 aa  1458    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  92.81 
 
 		 765 aa  1457    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  60.68 
 
 		 765 aa  992    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  41.15 
 
 		 799 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  39.21 
 
 		 847 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  37.1 
 
 		 846 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  37.13 
 
 		 847 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  36.22 
 
 		 847 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  35.83 
 
 		 796 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  38.53 
 
 		 818 aa  491  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  34.59 
 
 		 802 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  37.67 
 
 		 810 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  37.67 
 
 		 810 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  37.67 
 
 		 810 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  37.67 
 
 		 810 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  37.67 
 
 		 810 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  38.04 
 
 		 810 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  37.92 
 
 		 810 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  37.67 
 
 		 810 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  37.67 
 
 		 810 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  37.92 
 
 		 810 aa  479  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  37.67 
 
 		 810 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  37.92 
 
 		 810 aa  478  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  37.55 
 
 		 810 aa  476  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  37.05 
 
 		 810 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  37.17 
 
 		 807 aa  475  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  37.18 
 
 		 810 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  35.23 
 
 		 807 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  35.16 
 
 		 785 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  33.63 
 
 		 789 aa  443  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  32.91 
 
 		 805 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  34.34 
 
 		 847 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  33.5 
 
 		 848 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  35.09 
 
 		 786 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  34.85 
 
 		 831 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  34.21 
 
 		 808 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  33.71 
 
 		 846 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  34.47 
 
 		 834 aa  422  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  34.33 
 
 		 786 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  33.71 
 
 		 848 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  32.12 
 
 		 796 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  34.43 
 
 		 848 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  34.67 
 
 		 808 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  33.67 
 
 		 786 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  37.24 
 
 		 867 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  32.17 
 
 		 811 aa  393  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  32.1 
 
 		 831 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  33 
 
 		 786 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  30.95 
 
 		 830 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  32.45 
 
 		 826 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  32.25 
 
 		 828 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  32.46 
 
 		 828 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  31.78 
 
 		 825 aa  366  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  31.99 
 
 		 829 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  30.28 
 
 		 823 aa  362  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  31.31 
 
 		 782 aa  357  5e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  31.48 
 
 		 817 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  28.25 
 
 		 987 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  28.03 
 
 		 811 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  34.75 
 
 		 518 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  25.97 
 
 		 768 aa  230  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  28.09 
 
 		 752 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  24.64 
 
 		 862 aa  173  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  25.61 
 
 		 754 aa  160  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  25 
 
 		 749 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  24.9 
 
 		 756 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  25.15 
 
 		 749 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.29 
 
 		 749 aa  155  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.15 
 
 		 749 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  25 
 
 		 749 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  25 
 
 		 749 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  25 
 
 		 749 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  24.38 
 
 		 749 aa  153  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  24.52 
 
 		 749 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2980  formate acetyltransferase  25.92 
 
 		 758 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.235971 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  24.85 
 
 		 744 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  24.85 
 
 		 744 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  25.26 
 
 		 749 aa  152  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  25.08 
 
 		 760 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  24.85 
 
 		 755 aa  152  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  25 
 
 		 749 aa  151  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1080  formate acetyltransferase  25.77 
 
 		 759 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  24.25 
 
 		 742 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  25.1 
 
 		 743 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2718  formate acetyltransferase  24.05 
 
 		 742 aa  148  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3208  formate acetyltransferase  26.36 
 
 		 763 aa  147  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491624  hitchhiker  0.00152355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  24.74 
 
 		 749 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  24.92 
 
 		 760 aa  147  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3000  formate acetyltransferase  26.53 
 
 		 752 aa  146  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  24.96 
 
 		 742 aa  147  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  23.23 
 
 		 742 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>