211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001156 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  70.79 
 
 		 810 aa  1208    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  71.04 
 
 		 810 aa  1212    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  49.81 
 
 		 818 aa  818    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  71.04 
 
 		 810 aa  1211    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  71.16 
 
 		 810 aa  1214    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  100 
 
 		 807 aa  1680    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  71.16 
 
 		 810 aa  1214    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  70.42 
 
 		 810 aa  1202    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  70.92 
 
 		 810 aa  1211    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  70.79 
 
 		 810 aa  1208    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  71.04 
 
 		 810 aa  1212    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  71.16 
 
 		 810 aa  1210    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  48.79 
 
 		 802 aa  769    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  70.92 
 
 		 810 aa  1212    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  71.04 
 
 		 810 aa  1212    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  69.26 
 
 		 810 aa  1169    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  71.04 
 
 		 810 aa  1211    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  71.16 
 
 		 810 aa  1214    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  40.76 
 
 		 807 aa  599  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  38 
 
 		 805 aa  591  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  39.5 
 
 		 799 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  39.08 
 
 		 796 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  35.15 
 
 		 847 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  35.95 
 
 		 846 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  36.41 
 
 		 847 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  37.92 
 
 		 765 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  37.92 
 
 		 765 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  37.92 
 
 		 765 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  37.92 
 
 		 765 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  37.92 
 
 		 765 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  37.92 
 
 		 765 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  38.04 
 
 		 765 aa  482  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  38.04 
 
 		 765 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  37.17 
 
 		 765 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  37.55 
 
 		 765 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  37.17 
 
 		 765 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  35.9 
 
 		 765 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  35.01 
 
 		 785 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  35.4 
 
 		 786 aa  428  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  33.62 
 
 		 848 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  34.05 
 
 		 786 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  33.25 
 
 		 846 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  33.25 
 
 		 786 aa  405  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  33.54 
 
 		 808 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  32.47 
 
 		 789 aa  393  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  33.37 
 
 		 796 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  32.52 
 
 		 811 aa  392  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  31.96 
 
 		 831 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  31.73 
 
 		 830 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  33.46 
 
 		 828 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  33.58 
 
 		 825 aa  389  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  33.25 
 
 		 848 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  32.56 
 
 		 829 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  31.28 
 
 		 811 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  33.63 
 
 		 786 aa  376  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  32.75 
 
 		 826 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  32.59 
 
 		 782 aa  372  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  31.88 
 
 		 808 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  32.46 
 
 		 848 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  31.86 
 
 		 847 aa  364  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  32.18 
 
 		 823 aa  362  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  32.25 
 
 		 831 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  32.05 
 
 		 828 aa  357  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  34.75 
 
 		 847 aa  353  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  31.28 
 
 		 834 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  33.73 
 
 		 867 aa  327  6e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  29.17 
 
 		 817 aa  297  7e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  34.99 
 
 		 518 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  27.68 
 
 		 768 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  25.34 
 
 		 987 aa  227  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  27.44 
 
 		 862 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  25.53 
 
 		 752 aa  191  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  26.13 
 
 		 739 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  25.44 
 
 		 756 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2345  formate acetyltransferase  27.37 
 
 		 760 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36056  predicted protein  27.24 
 
 		 738 aa  181  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2243  formate acetyltransferase  27.55 
 
 		 760 aa  181  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1997  formate acetyltransferase  27.21 
 
 		 760 aa  180  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1729  formate acetyltransferase  26.83 
 
 		 760 aa  179  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00907  pyruvate formate lyase I  27.01 
 
 		 760 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2740  formate acetyltransferase  27.01 
 
 		 760 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1006  formate acetyltransferase  26.69 
 
 		 760 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1037  formate acetyltransferase  26.69 
 
 		 760 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101477  normal  0.620237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00914  hypothetical protein  27.01 
 
 		 760 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1064  formate acetyltransferase  27.01 
 
 		 760 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2425  formate acetyltransferase  27.01 
 
 		 760 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1071  formate acetyltransferase  26.69 
 
 		 760 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.54519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0978  formate acetyltransferase  26.69 
 
 		 760 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1423  formate acetyltransferase  26.3 
 
 		 760 aa  176  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1009  formate acetyltransferase  27.01 
 
 		 760 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0227334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2693  formate acetyltransferase  27.01 
 
 		 760 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456571 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1000  formate acetyltransferase  27.01 
 
 		 760 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.623819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1086  formate acetyltransferase  26.69 
 
 		 760 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2218  formate acetyltransferase  27.01 
 
 		 760 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  28.29 
 
 		 749 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  27.2 
 
 		 744 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  27.2 
 
 		 744 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  26.66 
 
 		 754 aa  174  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  26.65 
 
 		 748 aa  172  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  25.2 
 
 		 760 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>