211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5411 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  99.22 
 
 
765 aa  1576    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  99.48 
 
 
765 aa  1580    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.514532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  98.82 
 
 
765 aa  1571    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  92.42 
 
 
765 aa  1467    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  99.22 
 
 
765 aa  1576    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  61.07 
 
 
765 aa  1002    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  99.08 
 
 
765 aa  1571    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  92.42 
 
 
765 aa  1466    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  99.22 
 
 
765 aa  1576    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  100 
 
 
765 aa  1589    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  98.95 
 
 
765 aa  1573    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  99.22 
 
 
765 aa  1576    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  40.36 
 
 
799 aa  609  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  39.81 
 
 
847 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  37.25 
 
 
846 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  37.35 
 
 
847 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  37.25 
 
 
847 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  36.18 
 
 
796 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  34.92 
 
 
802 aa  495  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  37.97 
 
 
818 aa  484  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  37.55 
 
 
807 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  37.64 
 
 
810 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  37.39 
 
 
810 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  37.39 
 
 
810 aa  477  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  37.27 
 
 
810 aa  479  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  37.27 
 
 
810 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  37.27 
 
 
810 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  37.27 
 
 
810 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  37.14 
 
 
810 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  37.27 
 
 
810 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  37.27 
 
 
810 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  37.02 
 
 
810 aa  475  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  37.02 
 
 
810 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  37.02 
 
 
810 aa  475  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  36.77 
 
 
810 aa  476  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  35.86 
 
 
785 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  37.23 
 
 
810 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  33.84 
 
 
789 aa  454  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  34.22 
 
 
807 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  33.08 
 
 
805 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  33.96 
 
 
848 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  35.61 
 
 
786 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  34.3 
 
 
831 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  33.5 
 
 
846 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  34.22 
 
 
847 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  34.51 
 
 
848 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  34.21 
 
 
808 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  34.3 
 
 
786 aa  432  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  32.62 
 
 
796 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  33.42 
 
 
834 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  34.26 
 
 
786 aa  426  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  33.59 
 
 
848 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  34.3 
 
 
808 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  32.71 
 
 
811 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  33.17 
 
 
786 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  36.21 
 
 
867 aa  393  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  33.04 
 
 
828 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  31.35 
 
 
823 aa  385  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  32.63 
 
 
828 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  32.22 
 
 
831 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  31.46 
 
 
830 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  32.49 
 
 
782 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  32.75 
 
 
829 aa  379  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  32.74 
 
 
826 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  32.03 
 
 
825 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  31.65 
 
 
817 aa  349  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  29.01 
 
 
987 aa  333  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  28.54 
 
 
811 aa  325  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  35.01 
 
 
518 aa  273  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  26.31 
 
 
768 aa  235  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  24.69 
 
 
862 aa  190  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  27.65 
 
 
752 aa  175  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  24.02 
 
 
749 aa  157  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  25.04 
 
 
749 aa  157  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  24.78 
 
 
749 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  24.06 
 
 
742 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  25.07 
 
 
749 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  25.07 
 
 
749 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.36 
 
 
749 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.07 
 
 
749 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  25.07 
 
 
749 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  25.38 
 
 
744 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  25.38 
 
 
744 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  25.07 
 
 
749 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  24.81 
 
 
754 aa  155  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  25.62 
 
 
755 aa  155  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  24.39 
 
 
749 aa  154  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1080  formate acetyltransferase  25.99 
 
 
759 aa  154  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  24.28 
 
 
749 aa  154  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  24.57 
 
 
749 aa  154  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  25.95 
 
 
756 aa  153  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2980  formate acetyltransferase  25.66 
 
 
758 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.235971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  25.48 
 
 
743 aa  152  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2718  formate acetyltransferase  24.11 
 
 
742 aa  150  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3561  keto acid formate lyase  25.04 
 
 
760 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3588  formate acetyltransferase  25.59 
 
 
764 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3000  formate acetyltransferase  26.73 
 
 
752 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3429  formate acetyltransferase  25.27 
 
 
764 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1895  formate acetyltransferase  24.52 
 
 
753 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  24.93 
 
 
760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>