211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1246 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  43.35 
 
 		 799 aa  636    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  100 
 
 		 796 aa  1666    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  38.04 
 
 		 846 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  39.5 
 
 		 818 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  37.51 
 
 		 847 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  39.25 
 
 		 802 aa  558  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  36.68 
 
 		 847 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  36.56 
 
 		 765 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  36.69 
 
 		 765 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  36.56 
 
 		 765 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  36.56 
 
 		 765 aa  521  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  39.08 
 
 		 807 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  36.56 
 
 		 765 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  36.56 
 
 		 765 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  36.56 
 
 		 765 aa  522  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  36.56 
 
 		 765 aa  521  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  35.83 
 
 		 765 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  36.43 
 
 		 765 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  35.83 
 
 		 765 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  36.65 
 
 		 810 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  37.02 
 
 		 810 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  36.53 
 
 		 810 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  36.78 
 
 		 810 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  36.53 
 
 		 810 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  37.02 
 
 		 810 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  36.9 
 
 		 810 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  37.02 
 
 		 810 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  37.02 
 
 		 810 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  36.65 
 
 		 810 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  36.53 
 
 		 810 aa  505  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  36.53 
 
 		 810 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  36.41 
 
 		 810 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  36.43 
 
 		 765 aa  496  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  36.07 
 
 		 810 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  36.18 
 
 		 810 aa  492  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  42.49 
 
 		 847 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  35.28 
 
 		 805 aa  485  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  41.82 
 
 		 867 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  35.93 
 
 		 807 aa  477  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  35.88 
 
 		 796 aa  475  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  34.67 
 
 		 785 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  34.73 
 
 		 786 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  33.38 
 
 		 789 aa  455  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  34.85 
 
 		 786 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  34.18 
 
 		 786 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  33.72 
 
 		 786 aa  429  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  34.03 
 
 		 825 aa  428  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  33.16 
 
 		 811 aa  425  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  33.13 
 
 		 828 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  32.33 
 
 		 831 aa  405  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  31.87 
 
 		 830 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  32 
 
 		 808 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  32.92 
 
 		 826 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  32.3 
 
 		 829 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  32.08 
 
 		 823 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  32.64 
 
 		 828 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  31.23 
 
 		 848 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  32.35 
 
 		 811 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  31.98 
 
 		 808 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  31.08 
 
 		 846 aa  379  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  31.18 
 
 		 848 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  30.54 
 
 		 847 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  31.86 
 
 		 848 aa  366  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  30.35 
 
 		 782 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  29.91 
 
 		 817 aa  365  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  30.05 
 
 		 831 aa  360  7e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  30.14 
 
 		 834 aa  357  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  23.78 
 
 		 987 aa  272  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  32.05 
 
 		 518 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  28.75 
 
 		 768 aa  238  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  28.18 
 
 		 862 aa  235  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  27.02 
 
 		 742 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  26.79 
 
 		 749 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  27.85 
 
 		 756 aa  170  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  25.87 
 
 		 742 aa  170  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  26.56 
 
 		 749 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  26.91 
 
 		 744 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  26.91 
 
 		 744 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  26.2 
 
 		 749 aa  168  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  27.45 
 
 		 760 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  26.38 
 
 		 749 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1136  formate acetyltransferase  25.86 
 
 		 774 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.678757  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  26.69 
 
 		 749 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  26.69 
 
 		 749 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  26.69 
 
 		 749 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  26.36 
 
 		 739 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  26.02 
 
 		 749 aa  165  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  26.51 
 
 		 749 aa  163  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  26.51 
 
 		 749 aa  163  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  26.51 
 
 		 749 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1058  formate acetyltransferase  24.56 
 
 		 745 aa  162  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  26.33 
 
 		 749 aa  161  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  24.16 
 
 		 742 aa  161  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1543  formate acetyltransferase  25.58 
 
 		 755 aa  161  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0294136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36056  predicted protein  23.64 
 
 		 738 aa  160  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  27.12 
 
 		 748 aa  160  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0039  formate acetyltransferase  26.65 
 
 		 743 aa  160  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  26.38 
 
 		 752 aa  160  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  26.64 
 
 		 749 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  26.64 
 
 		 749 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>