208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3461 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  64.4 
 
 		 830 aa  1134    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  100 
 
 		 826 aa  1724    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  59.75 
 
 		 823 aa  1045    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  65.66 
 
 		 829 aa  1146    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  69.21 
 
 		 825 aa  1247    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  66.14 
 
 		 828 aa  1139    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  68.85 
 
 		 828 aa  1243    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  71.09 
 
 		 518 aa  799    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  63.63 
 
 		 831 aa  1100    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2755  pyruvate-formate lyase  65.54 
 
 		 326 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0853745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  34.84 
 
 		 848 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  34.25 
 
 		 799 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  35.66 
 
 		 785 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  33.45 
 
 		 802 aa  429  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  34.38 
 
 		 847 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  33.88 
 
 		 847 aa  429  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  33.01 
 
 		 848 aa  429  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  33.96 
 
 		 808 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  34.34 
 
 		 831 aa  415  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  32.47 
 
 		 846 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  33.42 
 
 		 811 aa  414  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  33.58 
 
 		 834 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  34.03 
 
 		 796 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  33.42 
 
 		 786 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  32.87 
 
 		 846 aa  405  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  32.92 
 
 		 796 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  30.51 
 
 		 805 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  32.41 
 
 		 786 aa  395  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  32.78 
 
 		 848 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  31 
 
 		 847 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  31.52 
 
 		 847 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  32.87 
 
 		 818 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  32.72 
 
 		 808 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  31.71 
 
 		 786 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  32.39 
 
 		 810 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  32.35 
 
 		 810 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  32.27 
 
 		 810 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  32.27 
 
 		 810 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  32.39 
 
 		 810 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  32.23 
 
 		 810 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  32.23 
 
 		 810 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  32.27 
 
 		 810 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  31.98 
 
 		 810 aa  376  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  31.98 
 
 		 810 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  32.47 
 
 		 786 aa  376  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  31.98 
 
 		 810 aa  376  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  32.1 
 
 		 810 aa  376  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  31.98 
 
 		 810 aa  376  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  32.75 
 
 		 807 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  32.91 
 
 		 765 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  33.04 
 
 		 765 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  33.04 
 
 		 765 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  32.78 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  32.45 
 
 		 765 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  32.87 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  32.78 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  32.45 
 
 		 765 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  32.78 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  32.91 
 
 		 765 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  32.78 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  31.47 
 
 		 807 aa  365  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  31.04 
 
 		 810 aa  364  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  31.22 
 
 		 789 aa  354  4e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  30.37 
 
 		 765 aa  352  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  31.3 
 
 		 810 aa  348  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  30.17 
 
 		 811 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  29.51 
 
 		 782 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  29.91 
 
 		 817 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  31.89 
 
 		 867 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  27.5 
 
 		 987 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  27.62 
 
 		 862 aa  225  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  24.92 
 
 		 768 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  24.17 
 
 		 756 aa  129  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  25.97 
 
 		 752 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  24.83 
 
 		 748 aa  126  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0505  formate acetyltransferase  25.5 
 
 		 742 aa  126  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  25.17 
 
 		 749 aa  125  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1080  formate acetyltransferase  26.45 
 
 		 759 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2980  formate acetyltransferase  26.45 
 
 		 758 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.235971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  24.1 
 
 		 749 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  24.44 
 
 		 749 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  24.96 
 
 		 739 aa  122  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2582  formate acetyltransferase  26.98 
 
 		 742 aa  120  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.435283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1356  formate acetyltransferase  25.21 
 
 		 744 aa  120  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.641068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1169  formate acetyltransferase  25.21 
 
 		 744 aa  120  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  24.27 
 
 		 749 aa  120  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  24.27 
 
 		 749 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  24.27 
 
 		 749 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  24.27 
 
 		 749 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  24.27 
 
 		 749 aa  119  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  24.27 
 
 		 749 aa  119  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  24.27 
 
 		 749 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  24.27 
 
 		 749 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  23.88 
 
 		 760 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0210  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 749 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0216  formate acetyltransferase  24.01 
 
 		 749 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3000  formate acetyltransferase  24.42 
 
 		 752 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1398  formate acetyltransferase  25.53 
 
 		 754 aa  117  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.763612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2096  formate acetyltransferase  23.82 
 
 		 751 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  25.17 
 
 		 756 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>