211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2191 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2191  formate C-acetyltransferase  100 
 
 
987 aa  2061    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0906  formate C-acetyltransferase  31.28 
 
 
782 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1397  glycerol dehydratase  28.39 
 
 
799 aa  353  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2101  formate acetyltransferase  30.73 
 
 
786 aa  342  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.384988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2965  pyruvate formate-lyase  28.78 
 
 
785 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0233628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5411  putative formate acetyltransferase 2  28.89 
 
 
765 aa  329  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0937  pyruvate-formate lyase  28.29 
 
 
808 aa  328  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4398  putative formate acetyltransferase 2  28.77 
 
 
765 aa  327  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.514532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03836  predicted formate acetyltransferase 2 (pyruvate formate lyase II)  28.64 
 
 
765 aa  326  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03785  hypothetical protein  28.64 
 
 
765 aa  326  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4185  putative formate acetyltransferase 2  28.64 
 
 
765 aa  326  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4065  putative formate acetyltransferase 2  28.64 
 
 
765 aa  326  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4437  putative formate acetyltransferase 2  28.64 
 
 
765 aa  325  4e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4035  pyruvate formate-lyase  28.52 
 
 
765 aa  324  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4490  putative formate acetyltransferase 2  28.52 
 
 
765 aa  324  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4905  Formate C-acetyltransferase  29.72 
 
 
848 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1437  Formate C-acetyltransferase  29.3 
 
 
786 aa  322  3e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3278  formate C-acetyltransferase  29.21 
 
 
847 aa  321  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3714  Formate C-acetyltransferase  28.71 
 
 
834 aa  320  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3543  Formate C-acetyltransferase  28.46 
 
 
831 aa  320  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1937  pyruvate formate-lyase  26.78 
 
 
765 aa  318  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000216234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2366  Formate C-acetyltransferase  29.72 
 
 
786 aa  317  6e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2476  Formate C-acetyltransferase  28.11 
 
 
796 aa  316  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0903  pyruvate formate-lyase  27.61 
 
 
846 aa  316  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4445  putative formate acetyltransferase 2  28.25 
 
 
765 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.299807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4519  putative formate acetyltransferase 2  28.25 
 
 
765 aa  314  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000438514 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1417  formate C-acetyltransferase  27.92 
 
 
848 aa  314  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4092  pyruvate formate-lyase  26.82 
 
 
847 aa  313  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3282  formate C-acetyltransferase  27.92 
 
 
846 aa  312  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1163  pyruvate formate-lyase  27.11 
 
 
847 aa  311  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.948697  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3039  formate C-acetyltransferase  28.59 
 
 
808 aa  307  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0169  Formate C-acetyltransferase  29.04 
 
 
811 aa  307  6e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17440  pyruvate-formate lyase  26.93 
 
 
789 aa  303  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1357  Formate C-acetyltransferase  26.86 
 
 
848 aa  297  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2499  pyruvate formate-lyase PFL  28.73 
 
 
786 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0491  formate C-acetyltransferase  29.1 
 
 
828 aa  290  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.212821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0366  Formate C-acetyltransferase  27.44 
 
 
825 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0979  formate C-acetyltransferase  29.02 
 
 
817 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2145  Formate C-acetyltransferase  28.92 
 
 
823 aa  281  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2750  formate C-acetyltransferase  27.68 
 
 
828 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1246  pyruvate formate-lyase  23.78 
 
 
796 aa  272  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1587  Formate C-acetyltransferase  27.79 
 
 
830 aa  272  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00731627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1174  pyruvate formate-lyase  25.2 
 
 
867 aa  270  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00269172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1273  formate C-acetyltransferase  27.75 
 
 
829 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1436  Formate C-acetyltransferase  27.24 
 
 
831 aa  265  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0944  formate C-acetyltransferase 3  25.56 
 
 
810 aa  257  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3703  pyruvate formate-lyase  26.76 
 
 
807 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0884  formate C-acetyltransferase 3  25.56 
 
 
810 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0994  formate C-acetyltransferase 3  25.56 
 
 
810 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0973  formate C-acetyltransferase 3  25.56 
 
 
810 aa  255  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2525  formate C-acetyltransferase 3  26.05 
 
 
810 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.802727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2821  pyruvate formate-lyase  26.17 
 
 
810 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0911  formate C-acetyltransferase 3  25.43 
 
 
810 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3461  Formate C-acetyltransferase  27.45 
 
 
826 aa  254  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2819  pyruvate formate-lyase  25.8 
 
 
810 aa  252  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0539131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0208  pyruvate formate-lyase  28.26 
 
 
847 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0848  formate C-acetyltransferase 3  25.8 
 
 
810 aa  252  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00790  predicted pyruvate formate lyase  25.8 
 
 
810 aa  251  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0331  formate acetyltransferase  24.85 
 
 
818 aa  251  4e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00807  hypothetical protein  25.8 
 
 
810 aa  251  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0894  formate C-acetyltransferas  25.68 
 
 
810 aa  251  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3259  pyruvate formate-lyase  24.91 
 
 
805 aa  251  6e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.435374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1317  pyruvate formate-lyase  24.91 
 
 
810 aa  250  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334389  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0881  formate C-acetyltransferas  25.8 
 
 
810 aa  250  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2642  pyruvate formate-lyase  25.68 
 
 
810 aa  248  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.611015  hitchhiker  0.000425531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1074  pyruvate formate-lyase  25.58 
 
 
802 aa  248  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.981923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001156  pyruvate formate-lyase  25.34 
 
 
807 aa  227  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3055  formate C-acetyltransferase  25.32 
 
 
811 aa  225  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2753  formate C-acetyltransferase  28.33 
 
 
518 aa  183  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23170  formate acetyltransferase  26.19 
 
 
739 aa  157  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1539  formate C-acetyltransferase glycine radical:pyruvate formate-lyase, PFL  24.92 
 
 
862 aa  155  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.811686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2718  formate acetyltransferase  23.98 
 
 
742 aa  154  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3208  formate acetyltransferase  25.3 
 
 
763 aa  150  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491624  hitchhiker  0.00152355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3390  formate acetyltransferase  25.27 
 
 
749 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3026  Formate C-acetyltransferase  23.73 
 
 
768 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0563  formate acetyltransferase  25.82 
 
 
749 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0424  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.82 
 
 
749 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0565  formate acetyltransferase  25.82 
 
 
749 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0420  formate C-acetyltransferase (formate acetyltransferase) (pyruvate formate-lyase)  25.82 
 
 
749 aa  149  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1048  formate C-acetyltransferase  26.21 
 
 
742 aa  149  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2418  formate acetyltransferase  25.98 
 
 
752 aa  147  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000891268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0481  formate acetyltransferase  25.64 
 
 
749 aa  147  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0509  formate acetyltransferase  25.64 
 
 
749 aa  147  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0426  formate acetyltransferase  25.64 
 
 
749 aa  147  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0490  formate acetyltransferase  25.64 
 
 
749 aa  147  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4811  formate acetyltransferase  25.45 
 
 
749 aa  146  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1721  formate acetyltransferase  25 
 
 
756 aa  146  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0444079  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0431  formate acetyltransferase  25.27 
 
 
749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0512  formate acetyltransferase  25.45 
 
 
749 aa  142  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2838  formate acetyltransferase  24.45 
 
 
760 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0892614 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1895  formate acetyltransferase  25.36 
 
 
753 aa  142  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349788  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0889  formate acetyltransferase  24.51 
 
 
756 aa  140  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02963  pyruvate-formate lyase  26.34 
 
 
765 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2366  formate acetyltransferase  24.25 
 
 
748 aa  137  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1457  formate acetyltransferase  26.71 
 
 
787 aa  135  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3503  formate acetyltransferase  25.36 
 
 
764 aa  135  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3429  formate acetyltransferase  25.36 
 
 
764 aa  135  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3432  formate acetyltransferase  25.36 
 
 
764 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1080  formate acetyltransferase  25.39 
 
 
759 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2980  formate acetyltransferase  25.39 
 
 
758 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.235971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>