103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2423 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  100 
 
 
305 aa  611  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  61.38 
 
 
294 aa  333  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  58.36 
 
 
281 aa  328  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.88 
 
 
281 aa  324  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  57.55 
 
 
281 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  56.12 
 
 
303 aa  319  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  62.3 
 
 
293 aa  317  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.58 
 
 
281 aa  315  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  55.28 
 
 
281 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  59.84 
 
 
280 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  55.16 
 
 
282 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  53.93 
 
 
281 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  55.83 
 
 
280 aa  309  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.64 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.64 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  54.64 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  61.8 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.64 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  54.64 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  60.42 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  54.64 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  65.04 
 
 
289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  54.87 
 
 
302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  54.64 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  61.73 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  60.42 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  59.44 
 
 
283 aa  299  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  60 
 
 
305 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  54.64 
 
 
310 aa  296  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  53 
 
 
291 aa  295  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  54.95 
 
 
309 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  52.56 
 
 
302 aa  293  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  48.94 
 
 
288 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  58.9 
 
 
287 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  49.48 
 
 
300 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  58.37 
 
 
293 aa  285  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  56.57 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  55.19 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  51.2 
 
 
300 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  53.15 
 
 
286 aa  276  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  57.81 
 
 
295 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  58.44 
 
 
310 aa  271  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  55.78 
 
 
306 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  50.91 
 
 
328 aa  268  1e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  60 
 
 
319 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  42.28 
 
 
352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  47.41 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  45.2 
 
 
285 aa  238  8e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.35 
 
 
281 aa  235  6e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  42.66 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  41.98 
 
 
322 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  43.31 
 
 
322 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  68.18 
 
 
132 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  39.11 
 
 
284 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  26.2 
 
 
279 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  26.17 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.03 
 
 
345 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  29.09 
 
 
363 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  27.89 
 
 
471 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  29.37 
 
 
474 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  28.99 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  28.57 
 
 
451 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  28.57 
 
 
451 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  28.18 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  22.87 
 
 
333 aa  49.7  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  26.15 
 
 
359 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  19.91 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  29.52 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  23.78 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  30.19 
 
 
265 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  24.72 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  29.93 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  27.27 
 
 
356 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.33 
 
 
270 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  28.79 
 
 
393 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  25.73 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  27.21 
 
 
471 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  27.34 
 
 
456 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  25.71 
 
 
452 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  23.62 
 
 
268 aa  46.6  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  27.36 
 
 
261 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  24.74 
 
 
278 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  25.41 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  23.81 
 
 
252 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  23.6 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  25.36 
 
 
464 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  27.06 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  23.66 
 
 
291 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0018  band 7 protein  28.23 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  23.44 
 
 
356 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  23.32 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  23.32 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  23.78 
 
 
409 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  29.94 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  46.3 
 
 
460 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  23.53 
 
 
376 aa  43.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  28.44 
 
 
298 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  26.87 
 
 
389 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  25.58 
 
 
347 aa  42.7  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  20.22 
 
 
256 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>