116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3197 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  100 
 
 
302 aa  622  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  70.75 
 
 
300 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  69.28 
 
 
300 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  65.27 
 
 
293 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  55.13 
 
 
303 aa  316  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  51.37 
 
 
282 aa  297  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.42 
 
 
281 aa  291  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  55.02 
 
 
310 aa  291  7e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.45 
 
 
281 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  53.65 
 
 
281 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  48.17 
 
 
328 aa  288  9e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  48.8 
 
 
281 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  57.89 
 
 
305 aa  279  5e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  58.02 
 
 
289 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  59.48 
 
 
294 aa  275  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  51.98 
 
 
293 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  57.2 
 
 
287 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  48.11 
 
 
280 aa  269  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  58.8 
 
 
284 aa  268  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  49.66 
 
 
309 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  50.35 
 
 
291 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  51.53 
 
 
309 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  58.19 
 
 
313 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  50.62 
 
 
280 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  51.41 
 
 
281 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  50.2 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  50.2 
 
 
281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  51.49 
 
 
281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.06 
 
 
281 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.06 
 
 
281 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.06 
 
 
281 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  51.06 
 
 
281 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  51.06 
 
 
281 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  50.2 
 
 
281 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  53.81 
 
 
283 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  45.02 
 
 
281 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  53.14 
 
 
315 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  50.4 
 
 
306 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  50.73 
 
 
305 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  47.26 
 
 
302 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  44.56 
 
 
288 aa  244  9e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  52.99 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  53.31 
 
 
319 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  50.88 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  53.02 
 
 
295 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  37 
 
 
352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.78 
 
 
281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  40.46 
 
 
322 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  42.59 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  41.54 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  42.15 
 
 
285 aa  199  6e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  40.5 
 
 
285 aa  193  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  56.06 
 
 
132 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  37.14 
 
 
284 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  26.47 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  24.86 
 
 
384 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  27.95 
 
 
393 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  27.66 
 
 
359 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.97 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  25.68 
 
 
385 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  26.63 
 
 
356 aa  52.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  28.37 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  29.11 
 
 
471 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  24.1 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  27.5 
 
 
474 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  24.73 
 
 
361 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  27.78 
 
 
471 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  30.83 
 
 
498 aa  49.7  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  29.08 
 
 
503 aa  49.3  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  24.76 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0924  HflK protein  25.4 
 
 
380 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  23.05 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  25.27 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  29.17 
 
 
355 aa  47.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  24.74 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  26.11 
 
 
451 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  26.11 
 
 
451 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  25.15 
 
 
409 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  24.23 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  26.11 
 
 
452 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  26.25 
 
 
386 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  26.13 
 
 
376 aa  45.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  27.53 
 
 
384 aa  45.8  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  26.52 
 
 
381 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  23.91 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  26.4 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.86 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  31.25 
 
 
399 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  26.95 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.68 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  29.23 
 
 
357 aa  43.9  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  25 
 
 
363 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  24.38 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  23.57 
 
 
382 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  23.35 
 
 
380 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  24.26 
 
 
399 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  24.74 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  27.36 
 
 
249 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  24.74 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  25.56 
 
 
464 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>