54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04452 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  100 
 
 
132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  84.09 
 
 
293 aa  229  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  74.24 
 
 
281 aa  201  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  68.18 
 
 
305 aa  185  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  66.67 
 
 
281 aa  184  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  61.94 
 
 
282 aa  180  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  65.91 
 
 
283 aa  176  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  65.41 
 
 
313 aa  175  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  62.88 
 
 
286 aa  172  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  63.43 
 
 
284 aa  169  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  61.36 
 
 
309 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  65.15 
 
 
305 aa  163  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  61.65 
 
 
302 aa  163  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  58.39 
 
 
287 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  58.33 
 
 
309 aa  162  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  62.12 
 
 
303 aa  162  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  62.12 
 
 
315 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  57.89 
 
 
281 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  57.58 
 
 
280 aa  161  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  61.36 
 
 
294 aa  160  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  56.82 
 
 
280 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  57.89 
 
 
281 aa  158  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  58.09 
 
 
291 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  59.85 
 
 
300 aa  158  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  57.89 
 
 
281 aa  157  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  57.89 
 
 
281 aa  157  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  60 
 
 
310 aa  157  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  57.89 
 
 
281 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  57.89 
 
 
281 aa  157  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  57.89 
 
 
281 aa  157  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  57.89 
 
 
281 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  57.89 
 
 
281 aa  157  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  57.89 
 
 
281 aa  157  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  57.89 
 
 
281 aa  156  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  57.14 
 
 
281 aa  156  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  61.36 
 
 
319 aa  156  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  56.06 
 
 
302 aa  155  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  57.89 
 
 
281 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  62.12 
 
 
310 aa  154  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  56.06 
 
 
300 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  55.15 
 
 
328 aa  151  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  57.35 
 
 
306 aa  151  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  63.16 
 
 
289 aa  147  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  53.96 
 
 
352 aa  147  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  62.88 
 
 
295 aa  147  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  57.25 
 
 
293 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  48.85 
 
 
288 aa  138  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.03 
 
 
281 aa  122  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  48.03 
 
 
285 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  46.46 
 
 
285 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  38.31 
 
 
322 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  37.25 
 
 
322 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  37.66 
 
 
322 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  40.94 
 
 
284 aa  90.5  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>