98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2250 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  100 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  75.86 
 
 
313 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  62.42 
 
 
305 aa  349  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  59.42 
 
 
309 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  57.62 
 
 
315 aa  334  9e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  53.9 
 
 
309 aa  315  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  63.32 
 
 
305 aa  300  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  58.94 
 
 
281 aa  295  7e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  51.53 
 
 
293 aa  292  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  54.12 
 
 
284 aa  291  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  50.19 
 
 
281 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  58.2 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  58.05 
 
 
287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  53.5 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  51.5 
 
 
281 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  48.6 
 
 
291 aa  281  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  56.73 
 
 
306 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  51.7 
 
 
294 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.08 
 
 
281 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  50.35 
 
 
282 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  57.94 
 
 
310 aa  279  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  47.7 
 
 
303 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  47.74 
 
 
280 aa  275  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  47.04 
 
 
281 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  52.63 
 
 
281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  52.63 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  52.63 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  52.63 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.63 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.63 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.63 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  54.31 
 
 
281 aa  272  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  45.64 
 
 
281 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  54.31 
 
 
281 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  53.45 
 
 
289 aa  269  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  41.87 
 
 
352 aa  268  7e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  55.97 
 
 
295 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  56.1 
 
 
319 aa  268  8.999999999999999e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  50 
 
 
280 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  43.16 
 
 
288 aa  265  8e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  55.28 
 
 
293 aa  261  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  49.32 
 
 
300 aa  259  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  49.66 
 
 
300 aa  258  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  48.91 
 
 
310 aa  255  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  47.95 
 
 
302 aa  251  9.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  41.85 
 
 
328 aa  248  6e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  41.18 
 
 
285 aa  219  3e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  41.61 
 
 
285 aa  218  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.15 
 
 
281 aa  211  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  41.03 
 
 
322 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  43.61 
 
 
322 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  43.24 
 
 
322 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  38.56 
 
 
284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  61.65 
 
 
132 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  25.84 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  27.86 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  27.86 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  25.64 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.52 
 
 
345 aa  55.8  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.36 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.81 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  25.13 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  28.57 
 
 
326 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  25.71 
 
 
333 aa  49.7  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  26.5 
 
 
281 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  24.31 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.19 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.99 
 
 
270 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  22.73 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  27.08 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  26.14 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.73 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2166  band 7 protein  24.49 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.67 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  20.88 
 
 
293 aa  46.2  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  25.14 
 
 
336 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  26.54 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  26.32 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  24.73 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  23.26 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  27.45 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  26 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  24.46 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  28.43 
 
 
254 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  25.62 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  22.37 
 
 
359 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  26.26 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1066  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  24.59 
 
 
512 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.63 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  26.77 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  23.98 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.56 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  25.97 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  25.14 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  23.55 
 
 
261 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  24.66 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.34 
 
 
334 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  25.93 
 
 
350 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>